More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4034 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 		 541 aa  1069    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  55.4 
 
 		 536 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  41.84 
 
 		 534 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6721  hypothetical protein  43.36 
 
 		 564 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  41.73 
 
 		 545 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  42.15 
 
 		 530 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  41.26 
 
 		 545 aa  309  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  37.2 
 
 		 535 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  37.27 
 
 		 535 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  39.56 
 
 		 544 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  40.95 
 
 		 576 aa  307  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1583  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  41.7 
 
 		 536 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4418  hypothetical protein  40.31 
 
 		 545 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  34.47 
 
 		 580 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1394  hypothetical protein  38.59 
 
 		 545 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  39.25 
 
 		 533 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4329  hypothetical protein  38.59 
 
 		 545 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1035  hypothetical protein  38.49 
 
 		 545 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  39.48 
 
 		 536 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  38.74 
 
 		 533 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  38.37 
 
 		 559 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.66 
 
 		 546 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.53 
 
 		 554 aa  269  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3820  hypothetical protein  38.46 
 
 		 522 aa  268  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366241  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  36.13 
 
 		 537 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  32.96 
 
 		 523 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  32.08 
 
 		 541 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  34.88 
 
 		 564 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  30.97 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  33.27 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.77 
 
 		 552 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  30.7 
 
 		 541 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  30.39 
 
 		 558 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0968  thiamine pyrophosphate protein central region  32.86 
 
 		 563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  31.26 
 
 		 543 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  32.21 
 
 		 547 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  31.48 
 
 		 587 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0852  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.9 
 
 		 552 aa  209  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.579609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  29.94 
 
 		 547 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  29.94 
 
 		 547 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  29.94 
 
 		 547 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  29.94 
 
 		 547 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  29.94 
 
 		 547 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  29.94 
 
 		 547 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  30.32 
 
 		 547 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.21 
 
 		 562 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  30.69 
 
 		 553 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.43 
 
 		 566 aa  202  9e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  31.94 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  27.58 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  30.09 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  30.84 
 
 		 578 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.78 
 
 		 557 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  29.94 
 
 		 547 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  28.28 
 
 		 587 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  30.15 
 
 		 572 aa  199  7.999999999999999e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  29.72 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  31.32 
 
 		 590 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  30.24 
 
 		 576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.58 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.96 
 
 		 584 aa  197  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.94 
 
 		 582 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  30.17 
 
 		 562 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.43 
 
 		 554 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.54 
 
 		 572 aa  196  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  27.92 
 
 		 587 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.8 
 
 		 612 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  33.97 
 
 		 605 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.66 
 
 		 542 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  28.15 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1536  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  33.16 
 
 		 582 aa  195  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.66 
 
 		 569 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30 
 
 		 562 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.73 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  30.11 
 
 		 623 aa  194  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.84 
 
 		 566 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  27.66 
 
 		 587 aa  193  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.58 
 
 		 632 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.54 
 
 		 557 aa  193  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.98 
 
 		 619 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  28.81 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05291  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.22 
 
 		 617 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.11 
 
 		 558 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.84 
 
 		 566 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.18 
 
 		 569 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1613  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.51 
 
 		 558 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  30.22 
 
 		 622 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.93 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.29 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.42 
 
 		 571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  28.87 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.45 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.09 
 
 		 619 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  27.87 
 
 		 546 aa  190  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  27.19 
 
 		 587 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.57 
 
 		 587 aa  190  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.02 
 
 		 619 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.57 
 
 		 588 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 570 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.64 
 
 		 596 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>