More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2938 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2938  ABC transporter related protein  100 
 
 
284 aa  557  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4272  ABC transporter related  71.96 
 
 
280 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2087  ABC transporter-related protein  72.59 
 
 
278 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1837  ABC transporter related  72.62 
 
 
290 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.076188  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1856  ABC transporter related  72.62 
 
 
290 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297219  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1903  ABC transporter related  72.62 
 
 
290 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3276  ABC transporter related protein  72.59 
 
 
277 aa  363  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610824  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13057  ATP-binding protein ABC transporter  73.23 
 
 
287 aa  362  4e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.172418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6066  ABC transporter related  66.54 
 
 
273 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28470  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  64.53 
 
 
270 aa  332  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.211213  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1093  ABC transporter related  62.59 
 
 
303 aa  322  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0497635  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1201  ABC transporter related  62.31 
 
 
291 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0510  ABC transporter related protein  62.11 
 
 
264 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3088  ABC transporter related  60.38 
 
 
278 aa  309  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000602664  hitchhiker  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13560  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  63.22 
 
 
264 aa  308  8e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.90103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2576  ABC transporter related  62.16 
 
 
264 aa  308  9e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486227  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0229  ABC transporter-like protein  61.66 
 
 
262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4852  ABC transporter related protein  61.92 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4815  ABC transporter related protein  58.04 
 
 
261 aa  291  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4096  ABC transporter related protein  58.85 
 
 
266 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.838726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21710  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  56.03 
 
 
272 aa  284  9e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0916485  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2053  ABC transporter related protein  59.06 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1875  ABC transporter related  57.87 
 
 
261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0360852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1427  ABC transporter related protein  57.85 
 
 
271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11610  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  53.87 
 
 
274 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2124  ABC transporter related  57.09 
 
 
261 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2315  ABC transporter related  56.6 
 
 
273 aa  275  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1154  ABC transporter related  56.81 
 
 
286 aa  275  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.312325  normal  0.608729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1177  ABC transporter related  52.65 
 
 
270 aa  274  9e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2897  ABC transporter related  58.04 
 
 
268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15830  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  56.4 
 
 
263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.196565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2313  ABC transporter related  56.63 
 
 
276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3500  ABC transporter related  55.02 
 
 
274 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.473481  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1242  ABC transporter related  53.85 
 
 
306 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151722  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0139  ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 
261 aa  252  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5340  ABC transporter related protein  54.09 
 
 
261 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.279807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3281  ABC transporter related  40.86 
 
 
262 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.121617  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3443  ABC transporter related protein  43.92 
 
 
271 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1607  ABC transporter ATP-binding protein  38.34 
 
 
260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.469845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1960  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  36.78 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0561  molybdenum ABC transporter ATPase  38.27 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.278332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1746  ABC transporter related  40.33 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0860  ABC transporter related  39.67 
 
 
280 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1562  ABC transporter related  41.41 
 
 
259 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1532  ABC transporter related  41.5 
 
 
259 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1586  ABC transporter related  41.41 
 
 
259 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1567  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285608  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2186  ABC transporter related  37.25 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2224  ABC transporter related  37.25 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0017  ABC transporter related  40.07 
 
 
275 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.930557  normal  0.586429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2812  ABC transporter-related protein  38.15 
 
 
264 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.618148  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1313  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  34.39 
 
 
260 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.292353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2512  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
260 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3604  ABC transporter related  37.22 
 
 
264 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221446  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0639  ABC transporter related protein  40.15 
 
 
265 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19640  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  38.89 
 
 
264 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0874856  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1786  ABC transporter related protein  40.96 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1179  ABC transporter related  35.92 
 
 
265 aa  139  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0729  ATPase  35.27 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0946  ABC transporter related  33.2 
 
 
272 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  33.59 
 
 
261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15661  ABC transporter ATP-binding protein  35.09 
 
 
263 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.478539 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1526  ABC transporter related protein  28.25 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.212645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 
267 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0297  ABC transporter, ATP-binding protein  31.66 
 
 
275 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0816  ATPase  26.85 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236174  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  34.58 
 
 
384 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08681  ABC transporter ATPase  26.09 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0041  ABC transporter related  33.69 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0921  ABC transporter-related protein  29.89 
 
 
269 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.293388  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08711  ABC transporter ATPase  24.7 
 
 
262 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11450  ABC-type molybdenum transport system, ATPase component/photorepair protein PhrA  33.72 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.259846  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1157  ABC transporter related  29.21 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0015  ABC transporter related  32.1 
 
 
336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0396331 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  24.29 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1076  ABC transporter related  35.4 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0753  ABC transporter related  33.19 
 
 
636 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_721  ABC-type molybdenum transport system ATPase component  28.41 
 
 
263 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.743216  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1016  ATPase  31.93 
 
 
265 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.701449  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1483  ATPase  31.62 
 
 
262 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0958108  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0217  ATPase  25.56 
 
 
270 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.175867  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1004  ABC transporter related  26.27 
 
 
271 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.675227  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2971  ABC transporter related  28.98 
 
 
500 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03594  ABC transporter ATP-binding protein  35.12 
 
 
290 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2704  ATP-binding component of molybdate transport system  32 
 
 
497 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00357864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2772  ABC transporter related  31.23 
 
 
289 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  31.3 
 
 
266 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2328  ABC transporter related  32.34 
 
 
272 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08491  ABC transporter ATPase  25 
 
 
270 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.467855  hitchhiker  0.00165058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  30.2 
 
 
269 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0357  ABC transporter related  25.29 
 
 
262 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211468  normal  0.0882999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  27 
 
 
266 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0737  ABC transporter related  28.14 
 
 
263 aa  102  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0491193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3063  molybdate transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
352 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0817  ABC transporter, ATP-binding protein  28.36 
 
 
263 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0653  ABC transporter related protein  29.33 
 
 
494 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3532  ABC transporter related  38.78 
 
 
479 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0781763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09491  ABC transporter ATPase  24.9 
 
 
262 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2209  ATPase  36.45 
 
 
271 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.412133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  31.34 
 
 
271 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>