More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2578 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  100 
 
 		 202 aa  394  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  68.68 
 
 		 198 aa  250  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  68.68 
 
 		 198 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  68.68 
 
 		 198 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  70.22 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  65.38 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3740  guanylate kinase  67.22 
 
 		 203 aa  227  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0778245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  66.31 
 
 		 203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  56.59 
 
 		 196 aa  204  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  55.56 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  53.89 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  54.35 
 
 		 195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  55.14 
 
 		 199 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  52.26 
 
 		 234 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  54.59 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  53.93 
 
 		 197 aa  184  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  54.19 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  51.91 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12720  guanylate kinase  54.4 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0387967  normal  0.0253788 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  47.37 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15620  guanylate kinase  50.77 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0579342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1318  guanylate kinase  50.29 
 
 		 183 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.117984  normal  0.348392 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  47.78 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  53.37 
 
 		 190 aa  177  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  51.55 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  50.26 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14800  guanylate kinase  51.69 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  46.03 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  44.51 
 
 		 199 aa  174  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  53.37 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  50.54 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  48.66 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  42.86 
 
 		 198 aa  171  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2042  guanylate kinase  51.7 
 
 		 180 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  decreased coverage  0.00281662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  45.6 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  47.83 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  48.35 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  45.6 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  48.9 
 
 		 189 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2992  Guanylate kinase  54.02 
 
 		 173 aa  168  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.40634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  46.15 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3127  guanylate kinase  54.84 
 
 		 203 aa  167  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  48.42 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  47.8 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  46.15 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.3 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  47.8 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  47.8 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1850  guanylate kinase  53.33 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.112941  normal  0.242923 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  47.8 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.24 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  48.13 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  40.11 
 
 		 204 aa  164  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1713  guanylate kinase  48.33 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781731 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  46.15 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  46.15 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  47.31 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  52.15 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  48.37 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  46.7 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0087  guanylate kinase  48.91 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  43.48 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  45.65 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  48.66 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  42.78 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  44.62 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  45.51 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.6 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  46.15 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  44.51 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  51.65 
 
 		 225 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  51.65 
 
 		 225 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  45.65 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  43.96 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  51.1 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  41.34 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2436  guanylate kinase  51.89 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  48.88 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  36.79 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  45.99 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  46.49 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  44.44 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  47.57 
 
 		 211 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  42.71 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  48.91 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  43.09 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  43.62 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  46.41 
 
 		 211 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  41.05 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  39.01 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  45.03 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  46.07 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  49.47 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  46.41 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  41.12 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  44.02 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  45.05 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  43.92 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  42.37 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  37.57 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>