132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1896 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1896  siroheme synthase  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.105096 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0119  siroheme synthase  75.7 
 
 		 283 aa  342  2e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.188255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1710  siroheme synthase  71.29 
 
 		 212 aa  300  1e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2248  siroheme synthase  68.25 
 
 		 215 aa  288  4e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0893363  normal  0.464998 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1731  siroheme synthase  34.58 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.381088  normal  0.846654 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1159  siroheme synthase  27.18 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.403167  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0522  hypothetical protein  32.09 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0965703  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0858  siroheme synthase  25.87 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0213  siroheme synthase  26.73 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000389168  normal  0.0129038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  34.05 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  31.25 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1088  siroheme synthase  24.38 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.604366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  32.8 
 
 		 465 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  32.8 
 
 		 465 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.19 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  25.87 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0817  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.4 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  28.81 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1587  siroheme synthase  23.38 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.7 
 
 		 480 aa  61.6  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  24.4 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  27.93 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1239  siroheme synthase  36.84 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.13 
 
 		 528 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  29.17 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.42 
 
 		 480 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  28.96 
 
 		 464 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  30.05 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2129  siroheme synthase  44.25 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1423  precorrin-2 dehydrogenase  25.93 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.747148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2781  siroheme synthase  28.21 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0880434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1576  siroheme synthase  28.21 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190124  hitchhiker  0.000000012919 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2886  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  27.33 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360303  hitchhiker  0.00000078916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1689  precorrin-2 dehydrogenase  25.93 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.428114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2801  siroheme synthase  27.56 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0131295  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0979  siroheme synthase  30.66 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.678356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1476  siroheme synthase  29.03 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.154904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  29.03 
 
 		 464 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2563  siroheme synthase  33.33 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.999316 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.38 
 
 		 472 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1762  siroheme synthase  27.01 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128247  normal  0.013009 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0830  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.86 
 
 		 473 aa  55.1  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  25.38 
 
 		 472 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0970  siroheme synthase  25.38 
 
 		 472 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.67 
 
 		 464 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  25.5 
 
 		 554 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.26 
 
 		 484 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  30.08 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  32.58 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  26.19 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  24.88 
 
 		 472 aa  52.8  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.87 
 
 		 487 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2876  siroheme synthase  27.56 
 
 		 303 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01486  siroheme synthase  28.79 
 
 		 326 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  25.63 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  29.36 
 
 		 489 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  27.63 
 
 		 493 aa  51.6  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.1 
 
 		 463 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  24.24 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  24.88 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.88 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.7 
 
 		 463 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3108  siroheme synthase, N-terminal component, putative  25.47 
 
 		 303 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3871  siroheme synthase  25.37 
 
 		 459 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2479  siroheme synthase  27.33 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.7 
 
 		 463 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  24.88 
 
 		 457 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  24.88 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  24.88 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  24.88 
 
 		 457 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4598  siroheme synthase  24.62 
 
 		 467 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  24.88 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  24.88 
 
 		 457 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.17 
 
 		 464 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  24.17 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3959  siroheme synthase  23.62 
 
 		 473 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1369  siroheme synthase  23.62 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  23.62 
 
 		 473 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  24.42 
 
 		 457 aa  50.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  25.6 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  27.69 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1453  siroheme synthase  24.84 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00644756  hitchhiker  0.00961472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  21.29 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1441  siroheme synthase  24.84 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  26.95 
 
 		 498 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1461  precorrin-2 oxidase / ferrochelatase  26.05 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1388  siroheme synthase  24.84 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4048  siroheme synthase  23.94 
 
 		 459 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32840  siroheme synthase, N-terminal domain protein  37.19 
 
 		 490 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.703694  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3719  siroheme synthase  23.62 
 
 		 470 aa  48.9  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.411824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  24.38 
 
 		 457 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  24.38 
 
 		 457 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  24.38 
 
 		 459 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2695  siroheme synthase  25 
 
 		 303 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  22.75 
 
 		 457 aa  48.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0658  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.9 
 
 		 447 aa  48.1  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.244252 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  23.88 
 
 		 457 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  29.5 
 
 		 313 aa  48.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  26.18 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>