More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1511 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1511  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
140 aa  288  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00655361  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0610  thioredoxin domain-containing protein  67.86 
 
 
140 aa  218  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000188847 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1573  thioredoxin domain-containing protein  68.79 
 
 
147 aa  205  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000000366383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1702  thioredoxin domain-containing protein  65.96 
 
 
142 aa  203  5e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00215418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  31.46 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  31.46 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  30 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  29.57 
 
 
162 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  32.14 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  32.47 
 
 
107 aa  58.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1859  thioredoxin  32.97 
 
 
130 aa  57.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.263827  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  31.36 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  27.84 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  25.55 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1343  thioredoxin  26.09 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  35.29 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3763  thioredoxin  31.33 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512539  normal  0.0469932 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06915  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13640)  33.33 
 
 
585 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  30.19 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  32.94 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  26.97 
 
 
324 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.97 
 
 
324 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0227  thioredoxin-related  31.03 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  27.71 
 
 
330 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  30.12 
 
 
334 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1614  thioredoxin  23.14 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  34.29 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  34.29 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  26.83 
 
 
241 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.76 
 
 
289 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3003  hypothetical protein  29.79 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2864  hypothetical protein  29.79 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  28.21 
 
 
150 aa  52.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  27.66 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  29.76 
 
 
289 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1362  thioredoxin  30.95 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  28.1 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  32.56 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  29.76 
 
 
268 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  30.12 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1151  thioredoxin  34.29 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  30.12 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  28.41 
 
 
302 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  30.23 
 
 
113 aa  52  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  30.12 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  29.76 
 
 
282 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  30.12 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  29.76 
 
 
282 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  30.12 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  33.33 
 
 
126 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  29.76 
 
 
282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3283  thioredoxin  32.14 
 
 
147 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  30.77 
 
 
282 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0496  thioredoxin  22.12 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00525354  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  24.49 
 
 
306 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  27.27 
 
 
302 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  34.94 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  30.77 
 
 
282 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  30.77 
 
 
282 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  30.77 
 
 
282 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  30.43 
 
 
290 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  27.66 
 
 
119 aa  50.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  27.06 
 
 
317 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  28.12 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  29.76 
 
 
282 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  29.79 
 
 
287 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  28.4 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  25.53 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  27.59 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  29.76 
 
 
406 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1200  Thioredoxin domain protein  23.16 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  24.47 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  25.81 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  27.71 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  28.57 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  27.71 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  31.25 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 
427 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  27.71 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  28.8 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  27.38 
 
 
290 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  30.95 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  28.92 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  27.71 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  28.57 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  33.73 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  30.59 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  27.71 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  25.47 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  27.71 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  29.67 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  30.85 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  27.71 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>