More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1799 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1799  signal peptidase I  100 
 
 		 288 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0193448  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0652  signal peptidase I  71.22 
 
 		 295 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1235  signal peptidase I  52.35 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000420804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1220  signal peptidase I  52.01 
 
 		 306 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000669884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0326  signal peptidase I  41.14 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  28.88 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  26.64 
 
 		 322 aa  85.5  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  29.66 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  27.3 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  28.57 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1676  signal peptidase I  29.41 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  26.07 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  26.85 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  27.01 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  27.14 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  27.86 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  27.96 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  28.06 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  27.7 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  27.6 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  29.64 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0373  signal peptidase I  25.86 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.444718  hitchhiker  0.000795915 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  24.73 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  25.36 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  27.41 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  27.41 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  27.41 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  27.63 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  27.63 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  27.63 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  26.22 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  27.61 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  27.24 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  30.2 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  25.46 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  26.95 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  24.56 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0681  signal peptidase I  24.91 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  25.55 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0292  signal peptidase I  23.96 
 
 		 432 aa  72  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  25.47 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  25.47 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  29.39 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  27.24 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  24.13 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  24.82 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  26.02 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1858  signal peptidase I  27.7 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  24.91 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  22.81 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1674  signal peptidase I  25.34 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  24.56 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0307  signal peptidase I  25.26 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1853  signal peptidase I  29.78 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2001  signal peptidase I  22.19 
 
 		 465 aa  69.3  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.220883 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  25.93 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  25.93 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2572  signal peptidase I  25.44 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0277547 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  25.93 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  25.93 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  25.93 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  27.46 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  25.93 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  23.55 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  34.17 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  25.93 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  25.44 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  25.44 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  25.44 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  25.44 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  25.44 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  32.21 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  26.71 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  25.44 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  25.44 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0906  signal peptidase I  24.54 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0211  signal peptidase I  22.03 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000129301  normal  0.0990099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  25.44 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  25 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1568  signal peptidase I  24.56 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0210004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  25 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  26.32 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  26.64 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  25 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0997  signal peptidase I  26.71 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611874  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  25 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  27.22 
 
 		 186 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0902  signal peptidase I  25.18 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  28.76 
 
 		 173 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4684  Signal peptidase I  25 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  26.71 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0282  signal peptidase I  24.34 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  24.73 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4299  signal peptidase I  24.29 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.826182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  25.27 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  25.71 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  24.21 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  25.71 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  23.9 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  22.93 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>