More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1044 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1044  amidohydrolase  100 
 
 
364 aa  744    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0081  amidohydrolase  48.78 
 
 
369 aa  353  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348917  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1410  amidohydrolase  46.07 
 
 
357 aa  331  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1276  amidohydrolase  46.93 
 
 
357 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000371736  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1219  amidohydrolase  38.64 
 
 
369 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4083  peptidase, M20/M25/M40 family  35.15 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1157  peptidase, M20/M25/M40 family  35.42 
 
 
376 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3807  amidohydrolase  36.06 
 
 
376 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.393808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3890  M20/M25/M40 family peptidase  35.21 
 
 
376 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4193  M20/M25/M40 family peptidase  35.21 
 
 
376 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3738  M20/M25/M40 family peptidase  35.21 
 
 
376 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3995  peptidase, M20/M25/M40 family  35.21 
 
 
376 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4100  peptidase, M20/M25/M40 family  35.21 
 
 
376 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0323014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4029  M20/M25/M40 family peptidase  34.93 
 
 
376 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3722  M20/M25/M40 family peptidase  35.21 
 
 
376 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2682  amidohydrolase  35.21 
 
 
376 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000743905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1824  amidohydrolase  34.08 
 
 
377 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0945  amidohydrolase  34.37 
 
 
376 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0294  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  33.97 
 
 
376 aa  212  7.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2834  amidohydrolase  30.25 
 
 
375 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.132688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1813  aminoacylase/N-acyl-L-amino acid amidohydrolase/hippurate hydrolase  32.44 
 
 
377 aa  195  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0614  amidohydrolase  31.22 
 
 
381 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0773  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  32.71 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.197987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  33.06 
 
 
390 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  30.66 
 
 
386 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1188  amidohydrolase  31.45 
 
 
387 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0669  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  29.63 
 
 
384 aa  170  4e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  32.49 
 
 
435 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  30.81 
 
 
393 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  31.78 
 
 
399 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  28.68 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  29.68 
 
 
381 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20651  zinc metallopeptidase  30.68 
 
 
394 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  30.83 
 
 
466 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  28.8 
 
 
381 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1761  amidohydrolase  32.18 
 
 
394 aa  162  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  29.4 
 
 
381 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  29.01 
 
 
381 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13725  predicted protein  28.86 
 
 
397 aa  160  4e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829613  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  29.97 
 
 
399 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  29.25 
 
 
393 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  29.28 
 
 
381 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  30.05 
 
 
465 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  28.45 
 
 
388 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  32.41 
 
 
390 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  30.89 
 
 
398 aa  156  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  30.89 
 
 
398 aa  155  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1706  peptidase M20D, amidohydrolase  31.64 
 
 
394 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  30.97 
 
 
394 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  29.53 
 
 
400 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  30.42 
 
 
465 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  31.97 
 
 
392 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  30.21 
 
 
465 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  28.53 
 
 
400 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  30.42 
 
 
471 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  30.42 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  31.94 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18021  zinc metallopeptidase  30.45 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1190  peptidase M20D, amidohydrolase  30.18 
 
 
394 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  29.79 
 
 
437 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  26.87 
 
 
405 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0164  peptidase M20D, amidohydrolase  27.68 
 
 
392 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  27.11 
 
 
400 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0594  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  31.56 
 
 
381 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00422123  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0120  peptidase M20D, amidohydrolase  25.75 
 
 
393 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000983179 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18231  zinc metallopeptidase  31.1 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  27.73 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  28.33 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  26.39 
 
 
389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18051  zinc metallopeptidase  31.44 
 
 
392 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.309423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1918  amidohydrolase family protein  28.65 
 
 
372 aa  147  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1030  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  29.92 
 
 
379 aa  147  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0220  amidohydrolase  28.18 
 
 
389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  29.75 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1911  amidohydrolase  29.17 
 
 
375 aa  146  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1298  amidohydrolase  27.49 
 
 
389 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  27.81 
 
 
432 aa  146  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  28.18 
 
 
396 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  30.08 
 
 
470 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  27.61 
 
 
397 aa  145  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3374  amidohydrolase  29.55 
 
 
446 aa  145  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.658502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  27.17 
 
 
405 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19910  amidohydrolase  26.49 
 
 
406 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547287  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01951  Zinc metallopeptidase M20/M25/M40 family protein  29.53 
 
 
398 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  26.72 
 
 
400 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  28.37 
 
 
393 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  27.17 
 
 
404 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2420  amidohydrolase  28.97 
 
 
398 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  29.33 
 
 
398 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04470  amidohydrolase  26.12 
 
 
399 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.171229  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  26.67 
 
 
403 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  26.6 
 
 
396 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  29.87 
 
 
439 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  25.82 
 
 
404 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7849  Aminoacylase  27.93 
 
 
419 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  29.06 
 
 
399 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  28.89 
 
 
395 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  26.67 
 
 
403 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  29.94 
 
 
394 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  29.79 
 
 
398 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>