77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0335 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0335  surface antigen variable number repeat protein  100 
 
 		 428 aa  857    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  27.81 
 
 		 553 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.71 
 
 		 895 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  24.36 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  25.3 
 
 		 803 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  24.38 
 
 		 752 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  30.91 
 
 		 790 aa  55.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  31.19 
 
 		 807 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1674  surface antigen (D15)  33.9 
 
 		 810 aa  53.9  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1112  surface antigen  27.16 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174162  normal  0.0271133 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0452  surface antigen (D15)  34 
 
 		 858 aa  53.1  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.150297  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0980  surface antigen  27.21 
 
 		 802 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00787602  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03805  hypothetical protein  35.37 
 
 		 762 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  29.13 
 
 		 744 aa  52.4  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.81 
 
 		 793 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.81 
 
 		 793 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  32.81 
 
 		 806 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  39.73 
 
 		 818 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  22.25 
 
 		 804 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0256  hypothetical protein  22.44 
 
 		 560 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.17253  normal  0.370888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.92 
 
 		 803 aa  49.7  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2265  surface antigen (D15)  23.74 
 
 		 839 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  22.51 
 
 		 683 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  36.49 
 
 		 785 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.7 
 
 		 803 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.51 
 
 		 752 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  24.51 
 
 		 765 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  29.27 
 
 		 796 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.21 
 
 		 970 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  31.82 
 
 		 772 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1900  surface antigen (D15)  37.11 
 
 		 772 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1464  surface antigen (D15)  32.32 
 
 		 851 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.68 
 
 		 810 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  21.68 
 
 		 810 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.88 
 
 		 848 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  26.67 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  30.08 
 
 		 805 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0535  OMP85 family outer membrane protein  28.16 
 
 		 793 aa  46.6  0.0007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  32.19 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.63 
 
 		 821 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  32.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3223  surface antigen variable number repeat protein  28.72 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  32.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  32.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  32.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  32.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  32.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.25 
 
 		 795 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.25 
 
 		 795 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.81 
 
 		 820 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.25 
 
 		 795 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  32.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  32.88 
 
 		 810 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.99 
 
 		 827 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.43 
 
 		 892 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2476  surface antigen (D15)  30.28 
 
 		 1002 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.738372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  30.61 
 
 		 844 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  36.99 
 
 		 827 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1285  surface antigen variable number repeat protein  28.26 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  36 
 
 		 807 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  36 
 
 		 961 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6501  surface antigen (D15)  37.5 
 
 		 808 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1510  hypothetical protein  32.62 
 
 		 1045 aa  44.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1689  surface antigen (D15)  31.55 
 
 		 1126 aa  45.1  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0689  surface antigen (D15)  29.36 
 
 		 1029 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  25.86 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  32.88 
 
 		 805 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0688  surface antigen (D15)  29.36 
 
 		 1024 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  35.62 
 
 		 827 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1562  surface antigen (D15)  36.99 
 
 		 827 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000380588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0654  surface antigen (D15)  32.35 
 
 		 1028 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  31.51 
 
 		 815 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  25 
 
 		 781 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.9 
 
 		 569 aa  43.1  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2095  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 775 aa  43.1  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.544397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.94 
 
 		 804 aa  43.1  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>