78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2147 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3323  band 7 protein  75.72 
 
 		 488 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2147  band 7 protein  100 
 
 		 450 aa  911    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.235634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2981  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  69.78 
 
 		 415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0384  band 7 protein  63.48 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3324  band 7 protein  29.53 
 
 		 607 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2982  hypothetical protein  29.69 
 
 		 536 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688388  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2148  band 7 protein  29.18 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0385  hypothetical protein  28.07 
 
 		 504 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.747749  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4125  HflK protein  29.27 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  28.21 
 
 		 284 aa  53.5  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  24.84 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  29.38 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  22.26 
 
 		 312 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  23.53 
 
 		 295 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  23.89 
 
 		 311 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  23.89 
 
 		 311 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  27.59 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  27.75 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.7 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  25.45 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  27.59 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2779  HflC protein  25.11 
 
 		 320 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  27.1 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  26.74 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  20.93 
 
 		 289 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  25.81 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  27.01 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  27.01 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  25.36 
 
 		 309 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  24.62 
 
 		 375 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  28.44 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  21.07 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  25.5 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  26.52 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  24.44 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  25.81 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  20.86 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  28.37 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  28.37 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  28.37 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.46 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  27.96 
 
 		 381 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  27.96 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  27.88 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  24.08 
 
 		 305 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  23.72 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.07 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.07 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0165  HflC protein  21.84 
 
 		 286 aa  45.1  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  24.61 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  24.61 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  24.07 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.07 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.07 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.07 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.07 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.07 
 
 		 315 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  23.46 
 
 		 317 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3629  band 7 protein  22.99 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00841169  hitchhiker  0.00129487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3203  HflK protein  25.24 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.143701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  25.24 
 
 		 377 aa  44.3  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3261  HflC protein  26.96 
 
 		 300 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.103141  normal  0.242798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  22.79 
 
 		 464 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.74 
 
 		 278 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  26.05 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  22.5 
 
 		 290 aa  43.5  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  24.43 
 
 		 351 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  21 
 
 		 310 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  25.13 
 
 		 454 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1722  HflK protein  26.26 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  25.59 
 
 		 474 aa  43.1  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  25.13 
 
 		 442 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  25.13 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  24.85 
 
 		 380 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1787  HflK protein  26.26 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  25.13 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  25.13 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  24.85 
 
 		 380 aa  43.1  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>