More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0962 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  100 
 
 		 474 aa  944    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  54.61 
 
 		 394 aa  362  8e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  42.99 
 
 		 457 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  42.32 
 
 		 443 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  41.03 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  35.1 
 
 		 446 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  33.26 
 
 		 455 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  33.71 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  38.72 
 
 		 476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  37.03 
 
 		 450 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  34.1 
 
 		 447 aa  229  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  33.64 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  35.85 
 
 		 449 aa  223  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  34.17 
 
 		 503 aa  217  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  31.85 
 
 		 448 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  37.66 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  38.46 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  38.79 
 
 		 473 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  36.46 
 
 		 468 aa  192  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  33.64 
 
 		 442 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  37.92 
 
 		 569 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  32.35 
 
 		 473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  29.71 
 
 		 461 aa  178  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  32.8 
 
 		 448 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  29.04 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  29.04 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  29.04 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  30.73 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  29.04 
 
 		 453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  28.05 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  30 
 
 		 506 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  28.79 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  28.57 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  28.1 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  28.1 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  27.89 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  28.1 
 
 		 453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  27.89 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.95 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  29.07 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  27.02 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.37 
 
 		 457 aa  136  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  29.01 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  30.36 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.46 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.99 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  29.07 
 
 		 570 aa  123  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  28.63 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  30.91 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.12 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  29.6 
 
 		 484 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  28.15 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  28.21 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  25.6 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  25.12 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.37 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  28.3 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  28.54 
 
 		 448 aa  118  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  28.81 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  26.07 
 
 		 429 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  30.54 
 
 		 454 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  23.69 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  25 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  26.94 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  25.29 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  23.68 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  25.74 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  25.74 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  25.98 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.38 
 
 		 428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  25.74 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  25.11 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  26.89 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  30.66 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  22.97 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  25.74 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  25.74 
 
 		 428 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  25.74 
 
 		 428 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  28.28 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  28.44 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  25.74 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  25.49 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  29.52 
 
 		 478 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  28.24 
 
 		 579 aa  113  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  25.49 
 
 		 428 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  24.16 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  29.48 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  22.51 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  24.77 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.63 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.93 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.98 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  26.62 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  26.46 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  26.62 
 
 		 443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  24.16 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.21 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  27.02 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.39 
 
 		 447 aa  110  7.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  28.31 
 
 		 471 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>