More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_5032 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  100 
 
 
131 aa  258  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  64.62 
 
 
129 aa  173  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  62.31 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  67.18 
 
 
131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  62.02 
 
 
128 aa  163  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  62.12 
 
 
132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  62.12 
 
 
132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  61.07 
 
 
129 aa  159  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  54.03 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  56.64 
 
 
129 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  49.62 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  46.88 
 
 
126 aa  134  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  45.97 
 
 
131 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 
126 aa  130  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  51.33 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.22 
 
 
126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.67 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  46.88 
 
 
127 aa  123  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  43.41 
 
 
126 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 
127 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 
128 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  43.75 
 
 
126 aa  121  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 
126 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 
126 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 
127 aa  119  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  46.09 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  41.6 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  42.4 
 
 
127 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
127 aa  118  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  44.36 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  43.2 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 
135 aa  117  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  44.35 
 
 
125 aa  117  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  45.24 
 
 
129 aa  116  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  40.48 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  44.19 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  45.31 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  47.24 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  45.74 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 
126 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  46.92 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  40.94 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  43.65 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  42.97 
 
 
127 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 
126 aa  114  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  42.06 
 
 
125 aa  114  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  41.27 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 
129 aa  114  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  43.41 
 
 
130 aa  114  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  40.48 
 
 
126 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  45.08 
 
 
129 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 
126 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  44.53 
 
 
129 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  45.31 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  44.88 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  48.6 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  44.19 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  41.09 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  48.08 
 
 
134 aa  111  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  41.09 
 
 
126 aa  110  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  44.19 
 
 
128 aa  110  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  49.56 
 
 
130 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0787  glycine cleavage system H protein  50.46 
 
 
128 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  42.52 
 
 
127 aa  110  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  44.19 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 
120 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  45.67 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  44.83 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  43.59 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  41.86 
 
 
129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  46.23 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  42.06 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  42.64 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 
129 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  44.26 
 
 
125 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 
129 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  45.31 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  43.93 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  43.41 
 
 
129 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>