44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1706 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  100 
 
 
563 aa  1125    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  43.76 
 
 
524 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  38.71 
 
 
549 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  38.03 
 
 
495 aa  290  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  22.38 
 
 
488 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  24.51 
 
 
476 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  24.51 
 
 
476 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  29.37 
 
 
399 aa  63.9  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  19.4 
 
 
723 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  23.31 
 
 
330 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  25.9 
 
 
392 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  39.74 
 
 
589 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  22.22 
 
 
520 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.42 
 
 
667 aa  50.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 
708 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  20.39 
 
 
677 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  31.25 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  32.91 
 
 
391 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  32.91 
 
 
391 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  21.79 
 
 
696 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0626  hypothetical protein  21.41 
 
 
480 aa  47.8  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  27.71 
 
 
706 aa  47.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  27.08 
 
 
339 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  28.48 
 
 
706 aa  47.4  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  22.71 
 
 
367 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  35.59 
 
 
785 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0701  hypothetical protein  21.12 
 
 
480 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  32.91 
 
 
569 aa  47  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  31.71 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  30.39 
 
 
358 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  38.46 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  31.71 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  20.46 
 
 
816 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  31.71 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  31.71 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  31.71 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  21.88 
 
 
696 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  31.17 
 
 
427 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1071  hypothetical protein  20.81 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.687156  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  34.21 
 
 
454 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  29.47 
 
 
442 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  29.41 
 
 
353 aa  44.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  24 
 
 
1045 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.26 
 
 
362 aa  43.9  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>