More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0644 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  57.9 
 
 		 586 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  61.51 
 
 		 575 aa  710    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3118  DNA repair protein RecN  57.73 
 
 		 586 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  61.62 
 
 		 582 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 592 aa  1207    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  57.9 
 
 		 586 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  56.9 
 
 		 595 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  53.68 
 
 		 581 aa  586  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2692  DNA repair protein RecN  38.79 
 
 		 560 aa  333  4e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30201  DNA repair protein RecN, ABC transporter  39.62 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2318  DNA repair protein RecN  38.14 
 
 		 561 aa  327  3e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.07 
 
 		 557 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.1 
 
 		 577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 		 567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 565 aa  303  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.69 
 
 		 559 aa  302  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.29 
 
 		 579 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.33 
 
 		 555 aa  300  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.21 
 
 		 562 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  34.79 
 
 		 579 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  35.21 
 
 		 554 aa  296  6e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  35.2 
 
 		 555 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.95 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.12 
 
 		 579 aa  294  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.78 
 
 		 583 aa  293  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.78 
 
 		 583 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.78 
 
 		 579 aa  293  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.78 
 
 		 579 aa  293  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.78 
 
 		 579 aa  293  9e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.78 
 
 		 579 aa  293  9e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.44 
 
 		 573 aa  292  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21971  DNA repair protein RecN, ABC transporter  34.47 
 
 		 561 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  33.69 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1324  ATPase  34.65 
 
 		 561 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  35.21 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.94 
 
 		 580 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  32.3 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  32.04 
 
 		 556 aa  287  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  34.04 
 
 		 565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18511  DNA repair protein recN, ABC transporter  35.06 
 
 		 568 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0157571  normal  0.0737248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  36.83 
 
 		 558 aa  283  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  33.78 
 
 		 562 aa  283  8.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  34.75 
 
 		 564 aa  280  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  35.29 
 
 		 559 aa  280  6e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 		 566 aa  279  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  32.71 
 
 		 587 aa  279  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  34.11 
 
 		 560 aa  278  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  34.18 
 
 		 586 aa  277  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 		 572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  34.68 
 
 		 572 aa  273  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  32.89 
 
 		 552 aa  269  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  31.65 
 
 		 605 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  32.35 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  31.22 
 
 		 561 aa  268  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  32.24 
 
 		 573 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 554 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  32.62 
 
 		 578 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 559 aa  264  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  33 
 
 		 572 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  34.79 
 
 		 557 aa  263  8e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  31.88 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  33.05 
 
 		 553 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 552 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  33.86 
 
 		 559 aa  261  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 552 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 552 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 		 574 aa  260  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  32.35 
 
 		 553 aa  259  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.99 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  33.67 
 
 		 575 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.87 
 
 		 553 aa  258  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  33.16 
 
 		 555 aa  257  5e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.65 
 
 		 588 aa  256  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 		 588 aa  256  7e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.18 
 
 		 552 aa  256  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.3 
 
 		 553 aa  256  8e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  32.38 
 
 		 556 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 553 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.78 
 
 		 588 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  32.12 
 
 		 553 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 		 551 aa  253  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  32.18 
 
 		 552 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  32.18 
 
 		 552 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  32.18 
 
 		 552 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  32.18 
 
 		 552 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1518  DNA repair protein RecN  30.76 
 
 		 579 aa  253  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.13 
 
 		 565 aa  253  9.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  29.74 
 
 		 562 aa  252  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  31.94 
 
 		 608 aa  253  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  31.94 
 
 		 556 aa  252  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  32.7 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  32.81 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  32.81 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  32.81 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  32.81 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  32.55 
 
 		 567 aa  251  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>