More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1788 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  57.45 
 
 
560 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  64.73 
 
 
560 aa  716    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  58.7 
 
 
560 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  73.27 
 
 
564 aa  827    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  70.9 
 
 
565 aa  828    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  66.67 
 
 
586 aa  744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  60.36 
 
 
571 aa  673    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  61.61 
 
 
569 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  57.45 
 
 
573 aa  636    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.93 
 
 
556 aa  682    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  68.76 
 
 
569 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.29 
 
 
568 aa  672    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  66.54 
 
 
569 aa  720    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.86 
 
 
567 aa  686    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  58.51 
 
 
560 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 
550 aa  1122    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  58.88 
 
 
560 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.5 
 
 
581 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  66.73 
 
 
556 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  74.09 
 
 
560 aa  841    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.25 
 
 
570 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  78.83 
 
 
562 aa  889    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  59.6 
 
 
581 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  59.41 
 
 
569 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  60.69 
 
 
573 aa  679    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  61.75 
 
 
592 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  58.88 
 
 
560 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  57.69 
 
 
590 aa  631  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.29 
 
 
570 aa  626  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  57.17 
 
 
563 aa  622  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  42.34 
 
 
567 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  39.56 
 
 
540 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  42.52 
 
 
521 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  39.56 
 
 
540 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  38.6 
 
 
586 aa  358  9.999999999999999e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  39.19 
 
 
540 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  39.19 
 
 
540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  39.19 
 
 
540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  39.19 
 
 
540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  39.19 
 
 
540 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  39.38 
 
 
540 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  39.01 
 
 
540 aa  356  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  39.19 
 
 
540 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  37.2 
 
 
542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  37.12 
 
 
519 aa  352  1e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  39.12 
 
 
540 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  37.83 
 
 
541 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.48 
 
 
591 aa  333  4e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  38.38 
 
 
591 aa  330  6e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.96 
 
 
592 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.79 
 
 
589 aa  324  2e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  36.04 
 
 
553 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  37.9 
 
 
643 aa  317  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.78 
 
 
603 aa  316  7e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  36.06 
 
 
551 aa  312  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  37.86 
 
 
510 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  39.15 
 
 
516 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.39 
 
 
569 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  36.45 
 
 
648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  36.27 
 
 
639 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  36.83 
 
 
586 aa  302  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.89 
 
 
805 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  36.71 
 
 
536 aa  299  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  37.78 
 
 
513 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  37.78 
 
 
513 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  38.12 
 
 
512 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  36.69 
 
 
492 aa  293  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.14 
 
 
793 aa  290  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  35.67 
 
 
521 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.84 
 
 
590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  33.4 
 
 
553 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  33.33 
 
 
553 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  32.85 
 
 
513 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  36.6 
 
 
599 aa  256  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  33.4 
 
 
513 aa  252  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  33.41 
 
 
480 aa  246  6e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  31.9 
 
 
542 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  32.75 
 
 
633 aa  240  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  31.97 
 
 
621 aa  236  8e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  33.69 
 
 
615 aa  236  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  32.42 
 
 
590 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  33.12 
 
 
595 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  30.62 
 
 
605 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  32.91 
 
 
595 aa  223  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  32.06 
 
 
586 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.87 
 
 
544 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.91 
 
 
757 aa  220  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  32.59 
 
 
548 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  31.78 
 
 
550 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  31.63 
 
 
586 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  31.38 
 
 
550 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  30.66 
 
 
552 aa  217  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  31.38 
 
 
550 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  30.63 
 
 
590 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  31.2 
 
 
552 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.89 
 
 
556 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  31.38 
 
 
550 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.78 
 
 
552 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.05 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  30.71 
 
 
556 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>