288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0149 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 248 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  49 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  49.19 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  44.8 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  44.35 
 
 		 272 aa  194  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  43.95 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 293 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  44.54 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  43.27 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 297 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 285 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 285 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 285 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 285 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 285 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  36.71 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  40.64 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  39.04 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  42.77 
 
 		 297 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  36.4 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  32.64 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  36.14 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  39.36 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  33.5 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 131 aa  53.1  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 151 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  25.95 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 136 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 137 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4036  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  27.83 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  43.84 
 
 		 129 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  30.11 
 
 		 124 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 177 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 147 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  33.75 
 
 		 128 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  34.48 
 
 		 135 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  43.06 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 144 aa  48.9  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  39.8 
 
 		 135 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 299 aa  48.9  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0189  MerR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528069  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.25 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 131 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 98 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  47.76 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 131 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  33.33 
 
 		 128 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 126 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  40.79 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1808  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 131 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306071  normal  0.126025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 92 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 132 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  40.24 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 142 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>