More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0219 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0219  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 
390 aa  808    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2199  amidohydrolase  59.69 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.320841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2454  amidohydrolase  54.29 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4114  amidohydrolase  53.21 
 
 
385 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1645  hippurate hydrolase  52.02 
 
 
368 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  41.69 
 
 
399 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  40.43 
 
 
403 aa  258  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1211  amidohydrolase  41 
 
 
384 aa  258  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.108173  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3523  peptidase M20D, amidohydrolase  40.1 
 
 
385 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  41.04 
 
 
399 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  38.4 
 
 
402 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.04 
 
 
387 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  42.08 
 
 
407 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  37.82 
 
 
380 aa  252  6e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  40.49 
 
 
384 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.3 
 
 
396 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  37.77 
 
 
379 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  39.08 
 
 
403 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  39.89 
 
 
404 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  39.74 
 
 
398 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  39.3 
 
 
387 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1882  peptidase, M20/M25/M40 family  40.31 
 
 
385 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  40.59 
 
 
389 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4873  amidohydrolase  38.95 
 
 
389 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.458115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  38.42 
 
 
398 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  39.89 
 
 
396 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  41.6 
 
 
395 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  39.31 
 
 
388 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  40 
 
 
425 aa  245  8e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  38.48 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  38.42 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  38.36 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  37.97 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1698  amidohydrolase  38.81 
 
 
406 aa  244  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.31217  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  38.17 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  38.21 
 
 
387 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  38.21 
 
 
387 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  38.5 
 
 
387 aa  242  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  37.9 
 
 
387 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  37.57 
 
 
386 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  36.2 
 
 
397 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 
396 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  40.69 
 
 
387 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  38.24 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  39.42 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  38.04 
 
 
401 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  36.53 
 
 
403 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  36.53 
 
 
403 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  40.16 
 
 
389 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  38.04 
 
 
401 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  37.97 
 
 
396 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  37.43 
 
 
396 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  37.6 
 
 
397 aa  239  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  37.97 
 
 
387 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  37.43 
 
 
396 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  37.57 
 
 
388 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  37.6 
 
 
401 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  38.44 
 
 
386 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  37.31 
 
 
381 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  38.48 
 
 
387 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  37.4 
 
 
397 aa  238  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  38.19 
 
 
395 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  35.97 
 
 
393 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6319  amidohydrolase  40 
 
 
373 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.834758  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  41.29 
 
 
396 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  36.53 
 
 
381 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  39.62 
 
 
392 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  37.43 
 
 
396 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  37.43 
 
 
396 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  41.29 
 
 
396 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  37.04 
 
 
397 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  37.43 
 
 
396 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3705  thermostable carboxypeptidase 1  37.14 
 
 
381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  37.7 
 
 
387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  37.34 
 
 
408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  37.43 
 
 
396 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  37.43 
 
 
396 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  37.43 
 
 
396 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0069  peptidase M20D, amidohydrolase  39.66 
 
 
384 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53846  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  36.53 
 
 
397 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  37.43 
 
 
396 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  37.04 
 
 
412 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  38.71 
 
 
387 aa  235  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  37.43 
 
 
394 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  37.43 
 
 
394 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  37.43 
 
 
394 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  41.29 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  41.29 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  41.29 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  38.63 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  35.97 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  37.4 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3698  M20/M25/M40 family peptidase  36.62 
 
 
381 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  37.4 
 
 
394 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1216  amidohydrolase  37.92 
 
 
386 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  37.77 
 
 
393 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  36.83 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  37.89 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2808  amidohydrolase  38.18 
 
 
385 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0984  peptidase M20D, amidohydrolase  36.41 
 
 
397 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>