76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1776 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1718  major facilitator transporter  94.31 
 
 		 369 aa  691    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1776  major facilitator transporter  100 
 
 		 369 aa  729    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.56574  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 391 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1739  major facilitator superfamily MFS_1  23.25 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.422247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  23.24 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  22.69 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  23.86 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  26.3 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  23.33 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  22.88 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2830  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.72 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.81 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02754  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2089  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3634  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.38 
 
 		 383 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 385 aa  52.8  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.19 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002202  probable 3-phenylpropionic acid transporter  26.18 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.32 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.32 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.32 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.32 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00166  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.81 
 
 		 342 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1141  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.42 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  24.42 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1132  phenyl proprionate permease family protein  24.42 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2820  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.42 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0314248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.42 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  24.42 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.42 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.17 
 
 		 379 aa  49.7  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.32 
 
 		 379 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.66 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  21.99 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2803  MFS family nucleoside/H(+) symporter  21.8 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  21.05 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1094  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.26 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  29.41 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  22.18 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1409  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.08 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  20.62 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.08 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  20.91 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>