137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1311 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  100 
 
 
205 aa  400  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  98.54 
 
 
205 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.41 
 
 
428 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.89 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1924  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.69 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1089  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.25 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0105  hypothetical protein  32.82 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0119  hypothetical protein  32.82 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.14 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.82 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0551  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.38 
 
 
223 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3305  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.95 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.8 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.51 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  26.59 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.5 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  44.87 
 
 
436 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  27.88 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.97 
 
 
210 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.56 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  29.94 
 
 
177 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2982  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.85 
 
 
195 aa  58.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.67 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0769894  normal  0.309987 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0800  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.57 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0692252  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  27.06 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.11 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0909  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.04 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000543789 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.67 
 
 
193 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.86 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01792  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.54 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0564739  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.51 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.53 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.5 
 
 
425 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0310  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.5 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.27 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.93 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2093  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.07 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1865  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.92 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.67 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0227  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.99 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000023759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.94 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10690  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0112608  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.09 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.88 
 
 
259 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.35 
 
 
204 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.52 
 
 
428 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  30.07 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.91 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0573622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01727  predicted phosphatidyl transferase, inner membrane protein  35.16 
 
 
206 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1884  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 
206 aa  52  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0561  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  34.52 
 
 
195 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01715  hypothetical protein  35.16 
 
 
206 aa  52  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.683573  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1874  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 
206 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.942197  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4301  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.05 
 
 
259 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.83 
 
 
265 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1842  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.16 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.948235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.16 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0013493  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.4 
 
 
202 aa  51.6  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2135  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 
198 aa  51.6  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2477  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.16 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1432  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  36.56 
 
 
206 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0819  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.14 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.0722385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0818  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.82 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.259617  normal  0.0304131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1272  hypothetical protein  29.81 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0545  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2962  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.38 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.5 
 
 
301 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1816  membrane protein  29.29 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.5 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3077  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.72 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000136505  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.41 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2070  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.41 
 
 
276 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0999876  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0624  hypothetical protein  25.27 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0754  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.41 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.623389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1047  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.41 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0695  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.41 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0352071  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2022  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.41 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.87 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2505  putative phosphatidyltransferase  25.45 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2141  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.61 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520042 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1911  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.2 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.608866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17430  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  30.64 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0943717 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0973  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40 
 
 
219 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1689  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.78 
 
 
205 aa  48.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4949  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1624  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.53 
 
 
192 aa  47  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.116279  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.19 
 
 
361 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.15 
 
 
218 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0784  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.9 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4239  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.11 
 
 
314 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1626  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.28 
 
 
236 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2999  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.22 
 
 
201 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4099  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.31 
 
 
322 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.38 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1236  hypothetical protein  39.39 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0976506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0881  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.85 
 
 
206 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.91 
 
 
530 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1593  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.2 
 
 
161 aa  45.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0759  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  32.99 
 
 
301 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00372597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.15 
 
 
410 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>