82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0989 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0971  hypothetical protein  97.97 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.736354  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0821  putative diguanylate cyclase  43.95 
 
 		 400 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 		 1267 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.53 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.47 
 
 		 662 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 		 666 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.75 
 
 		 648 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 646 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  29.17 
 
 		 669 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  29.17 
 
 		 666 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  29.17 
 
 		 666 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  24.5 
 
 		 646 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  36 
 
 		 666 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1328  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.73 
 
 		 658 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5256  methyl-accepting chemotaxis protein  29.17 
 
 		 666 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4882  methyl-accepting chemotaxis protein  29.17 
 
 		 666 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  34.67 
 
 		 666 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4841  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36 
 
 		 666 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5162  methyl-accepting chemotaxis protein  34.25 
 
 		 666 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.03 
 
 		 661 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  35.62 
 
 		 666 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 558 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 816 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.27 
 
 		 601 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0347  methyl-accepting chemotaxis protein DmcA  24.62 
 
 		 729 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28 
 
 		 660 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  35.96 
 
 		 885 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28 
 
 		 660 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  21.35 
 
 		 665 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.81 
 
 		 658 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 875 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.48 
 
 		 596 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  31.82 
 
 		 629 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  31.82 
 
 		 629 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 1078 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0126  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 613 aa  45.1  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  31.46 
 
 		 695 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  22.6 
 
 		 660 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0134  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.53 
 
 		 808 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 		 623 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  35.71 
 
 		 629 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 		 623 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1130 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.33 
 
 		 632 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  25.49 
 
 		 660 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  21.92 
 
 		 660 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 		 651 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1003  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.18 
 
 		 596 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.8 
 
 		 660 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 646 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.15 
 
 		 647 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 		 698 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000832175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.3 
 
 		 677 aa  43.5  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000502143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 		 625 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 		 625 aa  42.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  26.15 
 
 		 565 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 906 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  23.29 
 
 		 664 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 		 623 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 630 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.43 
 
 		 599 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  31.11 
 
 		 622 aa  42.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  64.29 
 
 		 633 aa  42.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.09 
 
 		 596 aa  42  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  21.23 
 
 		 660 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  21.23 
 
 		 660 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  21.23 
 
 		 660 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  21.23 
 
 		 660 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  21.23 
 
 		 660 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.43 
 
 		 698 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3209  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.25 
 
 		 601 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.23 
 
 		 650 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.68 
 
 		 660 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  23.93 
 
 		 647 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1204  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 		 553 aa  42  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.93 
 
 		 647 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  27.72 
 
 		 652 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.75 
 
 		 630 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  32.14 
 
 		 623 aa  41.2  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.03 
 
 		 624 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.13 
 
 		 660 aa  41.2  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>