More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0333 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 128 aa  256  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  93.75 
 
 		 128 aa  243  9e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0675  30S ribosomal protein S6  62.39 
 
 		 124 aa  146  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000724488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0636  30S ribosomal protein S6  49.57 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000427739  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0558  30S ribosomal protein S6  45 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.457125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  39.78 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  42.53 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  37.1 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  42.53 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  42.53 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  43.02 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 96 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  43.02 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  43.02 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  36.8 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  33.91 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  28.7 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  32.03 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  26.67 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  28.69 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  32.2 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  30.6 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000437004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  33.7 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  31.09 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 106 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  31.62 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  35.56 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1550  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1433  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  31.82 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  31.48 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  30.39 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  28.89 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  28.42 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  29.81 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>