More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3657 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3657  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0907  ABC transporter related  60.08 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.379648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0034  ABC transporter related  50.39 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3268  ABC transporter related  50.21 
 
 		 243 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.110762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000864  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter ATPase component  46.93 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0587  ABC transporter related  53.73 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.695126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06839  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.82 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3123  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2298  ABC transporter related  50.93 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.076659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0645  ABC transporter, ATPase subunit  50.47 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0487  ABC transporter, ATP binding protein  45.02 
 
 		 257 aa  181  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0927  ABC transporter related  45.56 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0131679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1932  ABC transporter related  47.75 
 
 		 251 aa  178  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2377  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 262 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1644  ABC transporter component  47.53 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0348832  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  41.15 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2295  ABC transporter related  41.51 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  39.78 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4614  ABC transporter related  38.84 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4676  ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4535  ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5037  ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4901  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  40.67 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4922  ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  42.79 
 
 		 261 aa  135  8e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0551  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  39.8 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.978201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  39.57 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  36.46 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  41.4 
 
 		 373 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  39.9 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2783  ABC transporter related  42.55 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 378 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  36.2 
 
 		 274 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2657  ABC transporter related  41.62 
 
 		 254 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  37.22 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  38.42 
 
 		 272 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  38.99 
 
 		 371 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  39.36 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  37.34 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  40.09 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  42.21 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  37.98 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  38.5 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  35.96 
 
 		 378 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1746  ABC transporter related  40.09 
 
 		 333 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  35.87 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  37.1 
 
 		 271 aa  129  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2749  sulfonate/taurine ABC transporter ATP-binding protein  38.94 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.71 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  38.1 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2776  ABC transporter related  38.89 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1974  ABC transporter related  42.58 
 
 		 299 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  40.58 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  33.99 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  36.41 
 
 		 297 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  39.81 
 
 		 357 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  35 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  35.11 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  36.91 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  34.8 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  43.65 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  37.98 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  37.95 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2499  aliphatic sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 		 335 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  34.22 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  40.43 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.58 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  41.12 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  37.56 
 
 		 272 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  39.06 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  38.86 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7248  ABC transporter ATP-binding protein  40.48 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00375076  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  39.18 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  37.5 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  35.78 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  40.96 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  38.16 
 
 		 297 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  41.12 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>