More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2666 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 
139 aa  276  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  69.78 
 
 
141 aa  197  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  70.5 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  69.78 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  68.38 
 
 
143 aa  194  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  75.71 
 
 
140 aa  190  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  68.38 
 
 
139 aa  184  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  56.39 
 
 
140 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  49.64 
 
 
140 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  54.14 
 
 
141 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.52 
 
 
140 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.68 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3971  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  57.25 
 
 
146 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.75 
 
 
139 aa  124  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.79 
 
 
140 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.49 
 
 
143 aa  124  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4298  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.07 
 
 
147 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  53.96 
 
 
144 aa  123  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  55.64 
 
 
141 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1390  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.63 
 
 
140 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.25 
 
 
144 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  53.28 
 
 
141 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.21 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  54.7 
 
 
141 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0634  class I peptide chain release factor  45.11 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0830  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.71 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.367677  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.85 
 
 
140 aa  117  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  49.23 
 
 
140 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.62 
 
 
139 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.6 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.06 
 
 
139 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.32 
 
 
137 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  50 
 
 
143 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_004310  BR2088  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.71 
 
 
178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  46.62 
 
 
141 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  50 
 
 
140 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  51.13 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2008  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50 
 
 
178 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0938485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.76 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4400  peptidyl-tRNA hydrolase domain-containing protein  44.85 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.485154  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4033  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.86 
 
 
139 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.471406  normal  0.87398 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  46.92 
 
 
139 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4177  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.36 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.378927  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.18 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000501  class I peptide chain release factor  44.12 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00818872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.45 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.45 
 
 
137 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.86 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.85 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  47.45 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0890  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.73 
 
 
138 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.45 
 
 
137 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.2 
 
 
134 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.2 
 
 
134 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.2 
 
 
134 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.2 
 
 
134 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  45.26 
 
 
137 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.2 
 
 
134 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.2 
 
 
134 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0550  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.61 
 
 
137 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  50.4 
 
 
134 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  49.59 
 
 
134 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.45 
 
 
137 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.45 
 
 
137 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.18 
 
 
137 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.45 
 
 
137 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.26 
 
 
137 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2086  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.59 
 
 
133 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.58 
 
 
140 aa  104  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3501  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.76 
 
 
143 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1386  class I peptide chain release factor  45.8 
 
 
141 aa  103  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3713  Class I peptide chain release factor  45.67 
 
 
140 aa  103  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 
137 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4325  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.88 
 
 
134 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0375174  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.39 
 
 
134 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  46.72 
 
 
146 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.09 
 
 
134 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.88 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285712  normal  0.465318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  41.01 
 
 
138 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.39 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0736  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.88 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.564723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.35 
 
 
138 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1217  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.88 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1100  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.09 
 
 
134 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.910918  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.61 
 
 
137 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  45.26 
 
 
137 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  47.58 
 
 
135 aa  100  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.34 
 
 
137 aa  101  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3412  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.61 
 
 
146 aa  100  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44659  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  45.16 
 
 
133 aa  100  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1036  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.61 
 
 
146 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.501059  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0267  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 
140 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0278  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 
140 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292576  normal  0.437885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 
140 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.232254  normal  0.925704 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1089  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.61 
 
 
146 aa  100  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.900586  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0262  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 
140 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.430585  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0281  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.65 
 
 
140 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.18 
 
 
140 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  47.41 
 
 
136 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013173  Dbac_2864  Class I peptide chain release factor  44.62 
 
 
137 aa  100  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10878  n/a   
 
 
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