More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2647 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013930  TK90_2647  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
385 aa  784    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.427362 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1357  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 
399 aa  208  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4311  putative metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 
408 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2773  hypothetical protein  34.86 
 
 
409 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0373  putative metal dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 
410 aa  170  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0258  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 
375 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4051  HD-GYP domain-containing protein  32.83 
 
 
449 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4666  putative metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
403 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0570  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 
417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  32.23 
 
 
413 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1003  putative metal dependent phosphohydrolase  29.98 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  30.8 
 
 
404 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2617  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
421 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2497  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
420 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.542039  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1847  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
420 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300439  hitchhiker  0.00112641 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2504  metal dependent phosphohydrolase  28 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.683485  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2258  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 
393 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1788  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2795  hypothetical protein  36.69 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2242  putative metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  29.83 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2752  putative metal dependent phosphohydrolase  31.85 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.380843  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  31.28 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 
439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  28.79 
 
 
395 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 
369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  28.14 
 
 
414 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
419 aa  113  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1539  putative metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 
418 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359761  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1942  HDIG domain-containing protein  27 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  27.5 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  27.93 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2807  metal dependent phosphohydrolase  27.44 
 
 
419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596042  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1721  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6453  normal  0.200178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1652  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
420 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1852  putative metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
349 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
373 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  30.04 
 
 
364 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 
369 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1577  metal dependent phosphohydrolase  26.33 
 
 
420 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4783  putative metal dependent phosphohydrolase  37.31 
 
 
329 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0983875  normal  0.561862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  29.06 
 
 
395 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
404 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0202  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
375 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2351  metal dependent phosphohydrolase  25.74 
 
 
421 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0796971  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  26.82 
 
 
377 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 
441 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
402 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3466  putative metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
330 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1894  HD-GYP domain-containing protein  25.07 
 
 
352 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1724  metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 
419 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  23.99 
 
 
410 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  27.06 
 
 
390 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 
389 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 
446 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
406 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
395 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0282  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 
448 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 
377 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
448 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1979  metal dependent phosphohydrolase  26.35 
 
 
431 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
341 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 
410 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2078  hypothetical protein  25.09 
 
 
417 aa  102  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000117952  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  23.92 
 
 
350 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2375  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 
407 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000143917  unclonable  0.000001487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 
412 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  28.32 
 
 
388 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 
388 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1256  HD domain-containing protein  25.16 
 
 
392 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0488462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3336  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 
356 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000315819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 
372 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
448 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2642  metal dependent phosphohydrolase  27.5 
 
 
401 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0489  HD-GYP domain-containing protein  32.89 
 
 
402 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0898  metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
345 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 
398 aa  99.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  28.64 
 
 
403 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  23.74 
 
 
366 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  29.68 
 
 
402 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3198  metal dependent phosphohydrolase  29.3 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1095  putative metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002441  HD-GYP domain-containing protein  27.44 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000172513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2693  HD-GYP domain-containing protein  32.3 
 
 
319 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  26.13 
 
 
424 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3114  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
446 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2489  metal dependent phosphohydrolase  26.87 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  26.28 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  26.73 
 
 
405 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>