75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1828 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1828  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 412 aa  822    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358298  hitchhiker  0.0000267475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  43.47 
 
 		 402 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  46.91 
 
 		 315 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2330  hypothetical protein  39.19 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0440768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  40.99 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0224  hypothetical protein  43.06 
 
 		 214 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0587288  normal  0.156271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1822  Methyltransferase type 11  40.89 
 
 		 213 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00574627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3170  methyltransferase type 11  45.1 
 
 		 219 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0295556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1120  hypothetical protein  46.29 
 
 		 217 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1270  hypothetical protein  46.86 
 
 		 217 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6034  hypothetical protein  43.78 
 
 		 211 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.335724  normal  0.0737922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2718  hypothetical protein  41.15 
 
 		 217 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0525784  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13313  predicted protein  39.53 
 
 		 229 aa  145  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37443  predicted protein  45.83 
 
 		 279 aa  143  6e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0385962  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1009  Methyltransferase type 11  45.68 
 
 		 215 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00599159  normal  0.0418085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  41.9 
 
 		 218 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2938  Methyltransferase type 11  38.42 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3179  hypothetical protein  38.42 
 
 		 216 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1926  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 213 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2053  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27591  predicted protein  39.18 
 
 		 241 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.861459  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  37.31 
 
 		 217 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1476  hypothetical protein  42.51 
 
 		 218 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.470823 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14201  hypothetical protein  38.6 
 
 		 217 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1031  hypothetical protein  46.58 
 
 		 217 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0256527  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  35.94 
 
 		 225 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13691  hypothetical protein  32.54 
 
 		 212 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0487979  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13391  hypothetical protein  32.56 
 
 		 214 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.417782  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_4604  predicted protein  38.8 
 
 		 209 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0142714  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0372  SAM-dependent methyltransferase  30.65 
 
 		 216 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118814  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10541  hypothetical protein  30.54 
 
 		 216 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.864146  hitchhiker  0.00665566 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1268  hypothetical protein  31.95 
 
 		 212 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.391733  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10751  hypothetical protein  37.72 
 
 		 215 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13601  hypothetical protein  31.36 
 
 		 212 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0525  Methyltransferase type 11  38.41 
 
 		 237 aa  113  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13458  predicted protein  40.27 
 
 		 207 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51541  methionine-dependent methyltransferase  24.32 
 
 		 214 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 269 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 269 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  33.64 
 
 		 237 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  47.92 
 
 		 281 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 283 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 260 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.58 
 
 		 258 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 239 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 237 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.16 
 
 		 356 aa  47.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 1106 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1647  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.21 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0262651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 634 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3382  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 312 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 240 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 996 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  32.43 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  34.95 
 
 		 658 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 1312 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 240 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 269 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  33.77 
 
 		 235 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  33.67 
 
 		 240 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  33.97 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 234 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.82 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  36.92 
 
 		 238 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4893  hypothetical protein  25.16 
 
 		 268 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148209  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  43.1  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  23.88 
 
 		 246 aa  43.1  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 275 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>