204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1608 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  494  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  28.4 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.97 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  32.54 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  28.95 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  34.21 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  30.84 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  31.19 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  31.19 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  31.19 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  30.84 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  28.14 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  31.19 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  31.19 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  27.39 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  31.19 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  30.19 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  24.54 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  25.59 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  22.94 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  25 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  22.71 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  26.53 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 233 aa  62  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  23.47 
 
 		 572 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  22.75 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  22.75 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  24.34 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  23.5 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.93 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  23.98 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  26.63 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  29.27 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  24.82 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  25.73 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.3 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  22.67 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  31.54 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  28.79 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 675 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  27.78 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  24.37 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  25.16 
 
 		 269 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  22.11 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  23.19 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.95 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.05 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  30.69 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  23.29 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  23.39 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  23.29 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  21.52 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.59 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  21.08 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  20.63 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.12 
 
 		 229 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.08 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.41 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  22.9 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  26.47 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.39 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  31.25 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  24.11 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>