More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0942 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  100 
 
 
575 aa  1177    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  31.51 
 
 
1537 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
918 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
1557 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 
576 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 
1538 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 
1538 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
824 aa  249  9e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 
903 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 
887 aa  240  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 
572 aa  239  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
564 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 
1542 aa  233  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 
606 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 
605 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 
819 aa  226  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  29.14 
 
 
564 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3483  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
620 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 
570 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  35.31 
 
 
624 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 
812 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 
562 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 
605 aa  216  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 
633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 
609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 
633 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  28.4 
 
 
824 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  28.62 
 
 
811 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.79 
 
 
610 aa  207  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 
592 aa  206  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  28.71 
 
 
824 aa  206  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 
825 aa  204  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 
592 aa  203  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  29.09 
 
 
825 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  31.53 
 
 
679 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 
607 aa  199  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
605 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
492 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 
610 aa  197  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 
622 aa  197  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  30.38 
 
 
587 aa  196  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.62 
 
 
610 aa  194  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 
511 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 
553 aa  194  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 
604 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.66 
 
 
610 aa  193  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
501 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.28 
 
 
514 aa  193  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  27.71 
 
 
580 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 
603 aa  193  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
580 aa  193  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 
490 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  29.33 
 
 
515 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 
604 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 
604 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 
598 aa  191  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 
620 aa  191  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 
603 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 
602 aa  190  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
592 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
520 aa  189  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 
603 aa  188  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 
647 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 
518 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
829 aa  187  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2597  long-chain fatty-acid-CoA ligase  27.61 
 
 
602 aa  186  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.366446 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 
684 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 
519 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.61 
 
 
524 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
597 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 
605 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0825  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 
601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.81 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 
521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.03 
 
 
490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  28.95 
 
 
551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 
826 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.67 
 
 
477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  27.06 
 
 
601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 
619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 
615 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.6 
 
 
614 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 
608 aa  183  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 
508 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  30.44 
 
 
606 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  28.94 
 
 
592 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  27.39 
 
 
551 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 
600 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 
511 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 
604 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  30.17 
 
 
607 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.97 
 
 
513 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 
609 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 
672 aa  181  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0332  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 
639 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  28.62 
 
 
514 aa  180  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 
639 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>