More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0702 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0702  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  51.36 
 
 
316 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.45 
 
 
316 aa  224  6e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.06 
 
 
334 aa  205  5e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.75 
 
 
308 aa  195  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.5 
 
 
308 aa  195  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.5 
 
 
308 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.56 
 
 
325 aa  193  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.49 
 
 
321 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.24 
 
 
279 aa  192  5e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  43.12 
 
 
312 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 
327 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  44.24 
 
 
330 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  43.64 
 
 
309 aa  188  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.75 
 
 
327 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
311 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.58 
 
 
308 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.5 
 
 
324 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.64 
 
 
322 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.24 
 
 
316 aa  185  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.59 
 
 
317 aa  185  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  40.83 
 
 
590 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  41.25 
 
 
590 aa  185  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.52 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 
576 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 
308 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  40.08 
 
 
270 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
327 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.42 
 
 
332 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.25 
 
 
323 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  41.08 
 
 
594 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  44.69 
 
 
307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  41.1 
 
 
310 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  41.1 
 
 
310 aa  181  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  39.15 
 
 
578 aa  181  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  42.61 
 
 
246 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3848  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
325 aa  181  8.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.45 
 
 
342 aa  181  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.14 
 
 
323 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  41.1 
 
 
308 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 
324 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.99 
 
 
279 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 
255 aa  180  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  39.5 
 
 
320 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.15 
 
 
338 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  40 
 
 
580 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  40.37 
 
 
311 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 
541 aa  180  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
578 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
580 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2055  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 
318 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.280833  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39 
 
 
578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  39 
 
 
578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  44.95 
 
 
330 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 
321 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.39 
 
 
312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
317 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.47 
 
 
309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  39 
 
 
578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  40.17 
 
 
579 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  39 
 
 
578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  40.27 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 
328 aa  179  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  38.46 
 
 
575 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  37.7 
 
 
582 aa  178  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  42.54 
 
 
300 aa  178  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
585 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.32 
 
 
317 aa  178  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 
266 aa  178  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  38.59 
 
 
582 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  44.6 
 
 
319 aa  178  8e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1472  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.6 
 
 
371 aa  178  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.269585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 
318 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.82 
 
 
319 aa  178  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 
337 aa  177  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.84 
 
 
282 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  43.14 
 
 
319 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  41.12 
 
 
279 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 
323 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 
331 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  38.03 
 
 
581 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  45.83 
 
 
301 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  41.94 
 
 
314 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.29 
 
 
359 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
578 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 
316 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  45.83 
 
 
305 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  41.12 
 
 
309 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.55 
 
 
446 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  38.59 
 
 
583 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 
309 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
578 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2351  ABC transporter related  38.89 
 
 
241 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
578 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>