126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0476 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  74.46 
 
 		 231 aa  377  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  70.04 
 
 		 227 aa  341  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  65.52 
 
 		 232 aa  324  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  65.52 
 
 		 232 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  63.16 
 
 		 228 aa  318  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  64.47 
 
 		 227 aa  313  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  61.57 
 
 		 228 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  62.83 
 
 		 230 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  62.9 
 
 		 230 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  61.95 
 
 		 232 aa  301  6.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  60.85 
 
 		 234 aa  300  9e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  62.83 
 
 		 227 aa  300  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  56.49 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  53.16 
 
 		 259 aa  275  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  55.31 
 
 		 230 aa  271  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  53.91 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  50.44 
 
 		 232 aa  248  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  51.34 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  50.89 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  51.34 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  50.44 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  49.12 
 
 		 236 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  47.14 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  43.23 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  37.89 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  39.83 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  38.86 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  38.33 
 
 		 236 aa  164  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  37.45 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  35.66 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  36.29 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  28.16 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  29.82 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  29.55 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  29.09 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  29.09 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  28.74 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  29.48 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  26.32 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  25.73 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  26.47 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  27.49 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  28.33 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0983  urease accessory protein UreG  28.27 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.942838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  26.32 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  28.4 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  24.55 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  26.63 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  28.9 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1666  hydrogenase accessory protein HypB  26.12 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  27.14 
 
 		 296 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1198  urease accessory protein UreG  29.03 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195176  normal  0.215478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  23.5 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4441  urease accessory protein UreG  28 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  28 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4513  hydrogenase accessory protein HypB  26.32 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0791  hydrogenase accessory protein HypB  27.49 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1358  urease accessory protein UreG  28.49 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  23.15 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0470  hydrogenase accessory protein HypB  28.81 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  24.87 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  26.26 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  25.88 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2183  hydrogenase accessory protein HypB  25.47 
 
 		 313 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.177735  normal  0.20266 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0469  hydrogenase accessory protein HypB  24.74 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.590808  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1137  urease accessory protein UreG  28.49 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  28.9 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  30.82 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  28.09 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  27.13 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  28.42 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1458  hydrogenase accessory protein HypB  26.2 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0664  urease accessory protein UreG  34.01 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.469815  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  32.45 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  26.6 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0871  hydrogenase accessory protein HypB  26.78 
 
 		 283 aa  45.8  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  25.84 
 
 		 352 aa  45.8  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  25.54 
 
 		 293 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1946  urease accessory protein UreG  29.8 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00965207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  23.88 
 
 		 277 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  23.94 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1049  urease accessory protein UreG  29.59 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.113322  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  30.73 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  32.19 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2548  hydrogenase accessory protein HypB  30.28 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0731217  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0335  hydrogenase accessory protein HypB  28.9 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.734472 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19201  urease accessory protein UreG  29.59 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0992  urease accessory protein UreG  29.14 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  31.05 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  31.05 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  31.05 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4213  urease accessory protein UreG  29.63 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  27.74 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  24.63 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0302  urease accessory protein G  29.8 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1756  urease accessory protein UreG  27.53 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0086861  normal  0.860103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  26.95 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5616  urease accessory protein UreG  30.27 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  25.7 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>