More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0364 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0364  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
518 aa  1038    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.71 
 
 
572 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  23.45 
 
 
552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.78 
 
 
583 aa  118  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.57 
 
 
579 aa  118  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0729  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  31.16 
 
 
595 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0382345  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  36.76 
 
 
706 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2736  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  21.63 
 
 
562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  33.33 
 
 
725 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.96 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.96 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.96 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.96 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1508  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydD  33.69 
 
 
591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000134779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.96 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  27.71 
 
 
566 aa  114  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.53 
 
 
582 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  22.31 
 
 
600 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.36 
 
 
597 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.8 
 
 
582 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.44 
 
 
600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  31.09 
 
 
728 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  34.57 
 
 
743 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  23.17 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.17 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  23.17 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.94 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.17 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.17 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.17 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.17 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.17 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.17 
 
 
582 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2757  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.13 
 
 
573 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000336134  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  29.53 
 
 
728 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  31.65 
 
 
626 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0739  ABC transporter related  24.11 
 
 
613 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327273  normal  0.0543304 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0343  ABC transporter related  25.18 
 
 
544 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  35.8 
 
 
590 aa  110  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  24.11 
 
 
582 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.67 
 
 
582 aa  110  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  24.24 
 
 
870 aa  110  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.24 
 
 
575 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.49 
 
 
555 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  24.14 
 
 
572 aa  109  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.69 
 
 
574 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_49993  ABC(ABCB) family transporter: multidrug (P-glycoprotein-like protein) (ABCB)  23.61 
 
 
521 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  23.27 
 
 
720 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  32.5 
 
 
742 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  40.24 
 
 
575 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.69 
 
 
574 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  31.5 
 
 
750 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  32.53 
 
 
573 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3122  ABC transporter related  29.79 
 
 
588 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1427  ABC transporter-like  30.04 
 
 
610 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.582294  normal  0.104251 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  32.53 
 
 
573 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.53 
 
 
573 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2443  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  33.33 
 
 
573 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0221682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3443  ABC transporter related  29.79 
 
 
588 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  21.18 
 
 
577 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2303  ABC transporter related protein  37.57 
 
 
552 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.347808  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.23 
 
 
586 aa  107  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  21.18 
 
 
585 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3319  ABC transporter related  34.71 
 
 
588 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.338254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.76 
 
 
639 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30 
 
 
575 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.2 
 
 
582 aa  107  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.95 
 
 
632 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.53 
 
 
573 aa  107  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.41 
 
 
552 aa  107  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.38 
 
 
598 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.88 
 
 
582 aa  107  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  21.55 
 
 
739 aa  107  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2206  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.95 
 
 
612 aa  107  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0959  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.53 
 
 
573 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000114694  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.81 
 
 
592 aa  106  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  22.69 
 
 
592 aa  107  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  21.5 
 
 
720 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0884  type I secretion system ATPase  31.72 
 
 
726 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.27 
 
 
582 aa  107  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.27 
 
 
582 aa  107  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.27 
 
 
582 aa  107  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00588  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  23.15 
 
 
569 aa  107  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232531  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  33.18 
 
 
721 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  25.53 
 
 
592 aa  106  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.87 
 
 
564 aa  106  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  30 
 
 
634 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  24.73 
 
 
611 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  31.72 
 
 
581 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  31.18 
 
 
608 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7369  ABC transporter related  27.78 
 
 
587 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0594477  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  26.46 
 
 
589 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0990  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.53 
 
 
573 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.034293  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2713  ABC transporter related  29.39 
 
 
609 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00697822  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.41 
 
 
595 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1207  putative ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA  23.57 
 
 
580 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.272032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2980  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.65 
 
 
602 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1895  ABC transporter related  25.6 
 
 
581 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0410  putative ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.11 
 
 
557 aa  105  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0698  ABC transporter, transmembrane region, type 1  36.02 
 
 
579 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.717868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>