More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13329 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13329  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  598  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1621  pseudouridine synthase  73.21 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4820  pseudouridine synthase  67.73 
 
 		 286 aa  364  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1278  pseudouridine synthase  70 
 
 		 287 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1251  pseudouridine synthase  69.64 
 
 		 287 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1268  pseudouridine synthase  69.64 
 
 		 287 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28660  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  54.24 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.727795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0554  pseudouridine synthase  55.4 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5332  pseudouridine synthase  58.13 
 
 		 302 aa  258  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.776192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4011  pseudouridine synthase  56.23 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0639  pseudouridine synthase  51.91 
 
 		 362 aa  251  9.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0672  pseudouridine synthase  51.7 
 
 		 309 aa  247  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0431  pseudouridine synthase  55.14 
 
 		 317 aa  245  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4251  pseudouridine synthase  45.79 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00270285  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3559  pseudouridine synthase  52.57 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1895  pseudouridine synthase  44.56 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0617  pseudouridine synthase  46.21 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2674  pseudouridine synthase  46.69 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930515 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1777  pseudouridine synthase  46.02 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0745  pseudouridine synthase  43.38 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2349  RNA pseudouridine synthase family protein  42.07 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2605  pseudouridine synthase  44.12 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2133  pseudouridine synthase  41.7 
 
 		 313 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20160  RNA pseudouridine synthase family protein  45.72 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4738  pseudouridine synthase  42.61 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3244  RNA pseudouridine synthase family protein  43.82 
 
 		 275 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0932  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  46.34 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4309  pseudouridine synthase  46.44 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38090  putative pseudouridylate synthase  42.91 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1453  pseudouridine synthase  41.97 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03250  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  42.71 
 
 		 348 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243016  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08910  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  45.14 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.267328  normal  0.027473 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08660  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  45.49 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1330  pseudouridine synthase  40.07 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0166738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2906  pseudouridine synthase  44.06 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2937  pseudouridine synthase  43.68 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.519419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3964  pseudouridine synthase  41.48 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2953  pseudouridine synthase  39.34 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1623  pseudouridine synthase  41.49 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449518  normal  0.260522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3537  pseudouridine synthase  38.38 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.966501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0572  pseudouridine synthase  38.75 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3712  pseudouridine synthase  38.95 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0418  pseudouridine synthase  36.86 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1629  pseudouridine synthase  40.96 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0257  pseudouridine synthase  37.64 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0549  pseudouridine synthase  37.92 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3629  pseudouridine synthase  41.35 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1652  pseudouridine synthase  40.82 
 
 		 294 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4073  pseudouridine synthase  38.89 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0482  pseudouridine synthase  37.89 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0459  pseudouridine synthase  36.9 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1531  pseudouridine synthase  36.08 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.216028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3881  pseudouridine synthase  36.53 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.792189  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0519  pseudouridine synthase  36.13 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0433  pseudouridine synthase  36.53 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0445  pseudouridine synthase  36.53 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0506  pseudouridine synthase  37.22 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3348  pseudouridine synthase  35.42 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242654 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1212  pseudouridine synthase  39.7 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3557  pseudouridine synthase  35.02 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02575  pseudouridylate synthase  43.92 
 
 		 206 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  36.36 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  36.97 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  36.97 
 
 		 323 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1506  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  35.43 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0155  pseudouridine synthase  35.43 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1751  pseudouridine synthase  33.18 
 
 		 219 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0485075  normal  0.0112767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0917  pseudouridine synthase  32.18 
 
 		 225 aa  92.8  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1430  pseudouridine synthase  33.63 
 
 		 223 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  32.15 
 
 		 623 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2896  pseudouridine synthase  31.63 
 
 		 218 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.76004  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0072  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.12 
 
 		 217 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0606  pseudouridylate synthase  31.92 
 
 		 225 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0311  pseudouridine synthase  36.19 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2488  pseudouridylate synthase  32.87 
 
 		 223 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177305  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1442  pseudouridylate synthase  31.86 
 
 		 223 aa  89.4  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81175  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2909  pseudouridine synthase  34.91 
 
 		 215 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1377  pseudouridylate synthase  32.58 
 
 		 223 aa  89.4  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  33.82 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2426  pseudouridine synthase  32.14 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3048  pseudouridylate synthase  33.97 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0799  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.54 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.603428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1328  pseudouridine synthase RluA-like  29.39 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3406  pseudouridine synthase  35.55 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0321433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0107  pseudouridine synthase, RluA family  29.3 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3139  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 225 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.33 
 
 		 225 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000100067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1467  pseudouridine synthase  30.2 
 
 		 217 aa  86.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2524  pseudouridylate synthase  32.05 
 
 		 230 aa  86.7  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349394  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2804  pseudouridylate synthase  36.1 
 
 		 215 aa  86.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.257511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0821  pseudouridylate synthase  30 
 
 		 225 aa  86.7  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0454843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3706  pseudouridine synthase  33.01 
 
 		 225 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3515  pseudouridine synthase  33.01 
 
 		 225 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.18243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3583  pseudouridine synthase  33.01 
 
 		 225 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0733  pseudouridine synthase  33.01 
 
 		 225 aa  85.5  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1883  pseudouridine synthase  38.42 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4024  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.52 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2226  pseudouridine synthase, RluD  30.11 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0834  pseudouridylate synthase  32.04 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1460  pseudouridine synthase  30.58 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>