More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11960 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11960  transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0515567  normal  0.606588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 321 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 321 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  45.95 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4459  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  64.77 
 
 		 227 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202493  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.85 
 
 		 338 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  30.98 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  35.85 
 
 		 334 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 334 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 362 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  32.68 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  28.63 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  53.57 
 
 		 341 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 372 aa  96.7  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 348 aa  95.5  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  30.23 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 338 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  52.38 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 325 aa  92  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 330 aa  92  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 321 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 351 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  52.38 
 
 		 320 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  32.22 
 
 		 332 aa  88.6  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  30.4 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 327 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  28.52 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  30.8 
 
 		 358 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  49.43 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  30.27 
 
 		 312 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  48.84 
 
 		 311 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  48.84 
 
 		 311 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  53.57 
 
 		 332 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  54.32 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  45.88 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  46.43 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  26.43 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  46.67 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  46.67 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  29.6 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  45.88 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  50 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  29.43 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  32.83 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  28.52 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  48.81 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  53.09 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  44.94 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  32.96 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  32.75 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>