More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11176 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  66.1 
 
 		 121 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  66.1 
 
 		 133 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  66.1 
 
 		 133 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  67.54 
 
 		 121 aa  159  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  68.42 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  46.79 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2572  transcriptional regulator, GntR family  59.49 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  45.79 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0570  transcriptional regulator, GntR family  43.52 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  47.86 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2078  GntR family transcriptional regulator  62.32 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202595  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3017  GntR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1998  transcriptional regulator, GntR family  42.34 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  49.54 
 
 		 120 aa  84.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1406  GntR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.024195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3399  transcriptional regulator, GntR family  46.94 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0501245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1819  transcriptional regulator, GntR family  63.24 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000455222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4945  transcriptional regulator protein-like protein  51.39 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.684518  normal  0.399116 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1484  regulatory protein GntR HTH  46.3 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00605871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  38.18 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  39.64 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  48.05 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  42.71 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18240  transcriptional regulator, GntR family  51.39 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.41291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2747  transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  53.03 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  36.71 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1094  transcriptional regulator, GntR family  51.35 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 498 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3796  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.87 
 
 		 471 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.975014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42 
 
 		 593 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4213  GntR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 432 aa  63.9  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0990086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.5 
 
 		 428 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 513 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  31.03 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2599  transcriptional regulator, GntR family  43.64 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10292  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0220  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.945987  normal  0.769281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4183  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 492 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 499 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0225  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06740  predicted transcriptional regulator  46.27 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.581792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 506 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1345  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  41.54 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 304 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2420  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.18 
 
 		 468 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  33.94 
 
 		 321 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  36.19 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1566  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50 
 
 		 444 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  40 
 
 		 476 aa  60.5  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08090  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.97 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000657612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 506 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  37.82 
 
 		 520 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2319  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000162157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  30.97 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  30.97 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.78 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5225  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.66 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 506 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 507 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4866  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0251878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>