More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_B2647 on replicon NC_007595
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007595  Synpcc7942_B2647  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.629356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.7 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.7 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.7 
 
 		 237 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.86 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.86 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  52.74 
 
 		 244 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.54 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 652 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 235 aa  191  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 226 aa  184  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  45.95 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.89 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 799 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 635 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  41.89 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  42.34 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  42.34 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0691  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 635 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 224 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.89 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.3 
 
 		 684 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  40.72 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2305  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 224 aa  175  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.44 
 
 		 223 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 229 aa  174  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.52 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.99 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  39.64 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.53 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.53 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.53 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.09 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>