More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2041 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2041  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 540 aa  1037    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.418304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0771  integral membrane protein MviN  63.44 
 
 		 553 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2723  integral membrane protein MviN  62.87 
 
 		 539 aa  620  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793041  normal  0.029084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  59.93 
 
 		 538 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1077  integral membrane protein MviN  58.36 
 
 		 533 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1048  integral membrane protein MviN  58.18 
 
 		 533 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1765  integral membrane protein MviN  60.63 
 
 		 540 aa  542  1e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.944825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2677  virulence factor MVIN-like  61.19 
 
 		 534 aa  531  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0249  integral membrane protein MviN  62.58 
 
 		 535 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24771  hypothetical protein  57.78 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0278  virulence factor MVIN-like  57.41 
 
 		 535 aa  488  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02881  hypothetical protein  48.3 
 
 		 535 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1627  virulence factor MVIN-like  46.64 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03391  hypothetical protein  47.11 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0314279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02941  hypothetical protein  38.72 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0263  integral membrane protein MviN  38.76 
 
 		 527 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02831  hypothetical protein  39.79 
 
 		 527 aa  303  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02841  hypothetical protein  40.84 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.15 
 
 		 521 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 		 523 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  29.55 
 
 		 528 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  29.57 
 
 		 529 aa  170  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  30.77 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 		 514 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  29.07 
 
 		 522 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  29.69 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 		 517 aa  157  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 		 517 aa  157  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.73 
 
 		 526 aa  156  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.74 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  30.11 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  29.69 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 		 573 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 		 511 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  28.98 
 
 		 521 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  29.83 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 		 517 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 		 519 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  31 
 
 		 541 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  28.64 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.09 
 
 		 517 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  29.78 
 
 		 522 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  28.11 
 
 		 530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  28.39 
 
 		 530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  28.04 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  29.08 
 
 		 519 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  30.22 
 
 		 521 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 534 aa  147  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  28.94 
 
 		 521 aa  147  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  30.29 
 
 		 511 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  29.66 
 
 		 498 aa  146  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  28.86 
 
 		 523 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  31.39 
 
 		 535 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  28.67 
 
 		 529 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  29.31 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  29.27 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  31.39 
 
 		 535 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 545 aa  144  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  28.96 
 
 		 521 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  29.24 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 519 aa  144  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  32.28 
 
 		 511 aa  143  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  30.97 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  28.12 
 
 		 523 aa  141  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  30.94 
 
 		 495 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  30.63 
 
 		 520 aa  141  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  30.53 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  29.35 
 
 		 529 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  28.35 
 
 		 534 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  29.19 
 
 		 523 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  27.63 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 		 555 aa  139  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  29.92 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  29.17 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  23.96 
 
 		 523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  28.19 
 
 		 525 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  31.08 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  28.84 
 
 		 545 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.4 
 
 		 519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  30.18 
 
 		 521 aa  136  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  24.31 
 
 		 539 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  28.27 
 
 		 542 aa  136  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  27.82 
 
 		 533 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  27.89 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  29.71 
 
 		 521 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 511 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.24 
 
 		 613 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  29.22 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  29.22 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  30.04 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  29.22 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  28.48 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  29.89 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  24.63 
 
 		 512 aa  135  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  28.48 
 
 		 519 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>