More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0478 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  59.14 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  60.45 
 
 		 193 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  56.99 
 
 		 198 aa  231  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  61.29 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  57.45 
 
 		 209 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  58.38 
 
 		 190 aa  215  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  57.8 
 
 		 190 aa  210  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  53.26 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  53.29 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  50.6 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  50.6 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  44.17 
 
 		 173 aa  164  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  43.5 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  45.61 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  43.62 
 
 		 220 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  45.03 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  45.78 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  44.15 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  45.56 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1149  Signal peptidase I  42.86 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.867763  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  47.16 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  44.26 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  41.15 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  50 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0606  leader peptidase I  43.89 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  42.68 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  41.71 
 
 		 173 aa  141  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  45.57 
 
 		 196 aa  141  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  45.34 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  42.86 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  42.86 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  37.95 
 
 		 217 aa  135  5e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  47.56 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  39.39 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  42.24 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  44.44 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  41.62 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  43.36 
 
 		 373 aa  131  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  37.29 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12270  signal peptidase I  40 
 
 		 173 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  43.36 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  43.36 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  43.2 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  41.31 
 
 		 313 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  43.67 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  39.34 
 
 		 341 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00350  signal peptidase I  45.22 
 
 		 191 aa  124  9e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  41.34 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0350  signal peptidase I  35 
 
 		 193 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  37.25 
 
 		 199 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  35.93 
 
 		 286 aa  121  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  35.78 
 
 		 230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3754  signal peptidase I  42.57 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000114427  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  38.61 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  36.8 
 
 		 284 aa  118  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  35.78 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  36.41 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  37.2 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1374  signal peptidase I  40.88 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000766434  normal  0.363183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  36.94 
 
 		 294 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  33.83 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  35.29 
 
 		 231 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  36.24 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  40.11 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  36.24 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  36.24 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  41.76 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  34.71 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  39.55 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  40.65 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  33.99 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  37.44 
 
 		 220 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  37.13 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  35.47 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  33.47 
 
 		 304 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  35.58 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  36.42 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  36.72 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  34.98 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  36.14 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  36.11 
 
 		 288 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  32.72 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  35.16 
 
 		 338 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  34.45 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  37.43 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1621  signal peptidase I  34.2 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.617556  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  33.16 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1267  signal peptidase I  35.88 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00305059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  34.7 
 
 		 289 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  34.48 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  36.26 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  35.23 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  34.7 
 
 		 290 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  35 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  31.86 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  39.66 
 
 		 434 aa  104  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  34.62 
 
 		 262 aa  104  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  36.26 
 
 		 183 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  35.47 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>