More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0063 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  100 
 
 		 447 aa  895    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  89.29 
 
 		 469 aa  806    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  66.52 
 
 		 479 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  55.76 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  55.83 
 
 		 472 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  55.61 
 
 		 472 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  46 
 
 		 473 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  45.54 
 
 		 477 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  45.1 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  45.73 
 
 		 474 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  44.02 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  40.92 
 
 		 474 aa  362  9e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  39.36 
 
 		 460 aa  345  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  38.93 
 
 		 485 aa  345  7e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  38.14 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  38.78 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  38.78 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  37.89 
 
 		 500 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.58 
 
 		 429 aa  226  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.21 
 
 		 433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  31.76 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  31.76 
 
 		 433 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.53 
 
 		 435 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.68 
 
 		 426 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  32.2 
 
 		 432 aa  202  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.61 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  29.16 
 
 		 431 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.57 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.96 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.96 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.96 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.96 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  33.96 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.96 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.96 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.89 
 
 		 427 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.55 
 
 		 488 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.69 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.69 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.69 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  29.65 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.78 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  31.47 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.51 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.08 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.09 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.29 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.96 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  28.28 
 
 		 446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  32.05 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  30.96 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  26.79 
 
 		 433 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  29.69 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  31.03 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  31.93 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  31.93 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  31.93 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  30.36 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.39 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  32.07 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.9 
 
 		 428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30.11 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  29.34 
 
 		 436 aa  173  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  32.46 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  29.4 
 
 		 435 aa  173  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.62 
 
 		 435 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  29.69 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.59 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  29.69 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  29.69 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  29.69 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  29.69 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  29.75 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  29.75 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  29.75 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  29.75 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  29.75 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  29.75 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  29.75 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  29.75 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  31.79 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.04 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  31.42 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  32.08 
 
 		 428 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.11 
 
 		 445 aa  169  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  27.74 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  27.29 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  30.04 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  29.53 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  29.5 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  29.39 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  26.58 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  28.85 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  30.02 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  30.66 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  28.73 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  30.02 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  27.53 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  28.79 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  28.79 
 
 		 434 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>