More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2426 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2426  pseudouridine synthase  100 
 
 		 315 aa  639    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2106  pseudouridine synthase  68.98 
 
 		 315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27171  pseudouridine synthase  49.17 
 
 		 338 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3242  pseudouridine synthase, RluA family  43 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  normal  0.607359 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4020  pseudouridine synthase, RluA family  41.47 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3978  pseudouridine synthase, RluA family  41.14 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5191  pseudouridine synthase, RluA family  38.08 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000721787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2882  RluA family pseudouridine synthase  40.92 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2226  pseudouridine synthase, RluD  39.34 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  32.09 
 
 		 623 aa  116  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3557  pseudouridine synthase  28.69 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1895  pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2953  pseudouridine synthase  32.78 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1453  pseudouridine synthase  31.56 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3537  pseudouridine synthase  30.45 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.966501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3712  pseudouridine synthase  30.45 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1623  pseudouridine synthase  33.75 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449518  normal  0.260522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0418  pseudouridine synthase  29.63 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3881  pseudouridine synthase  28.46 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.792189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0572  pseudouridine synthase  30 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0433  pseudouridine synthase  28.46 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0459  pseudouridine synthase  28.46 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0445  pseudouridine synthase  28.46 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  32.92 
 
 		 350 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0519  pseudouridine synthase  28.05 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1330  pseudouridine synthase  30.71 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0166738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  30.77 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1531  pseudouridine synthase  25.62 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.216028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2605  pseudouridine synthase  28.85 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  32.49 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  32.49 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3629  pseudouridine synthase  30.49 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  31.44 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4073  pseudouridine synthase  28.34 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0261  pseudouridine synthase  24.42 
 
 		 336 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4251  pseudouridine synthase  29.55 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00270285  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0482  pseudouridine synthase  27.24 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33477  DRAP deaminase  28.81 
 
 		 585 aa  90.5  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.261571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1777  pseudouridine synthase  30.04 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  32.18 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2674  pseudouridine synthase  29.55 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3244  RNA pseudouridine synthase family protein  30.99 
 
 		 275 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  30.64 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2133  pseudouridine synthase  29.55 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1652  pseudouridine synthase  29.67 
 
 		 294 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1629  pseudouridine synthase  29.1 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0506  pseudouridine synthase  28.35 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.27 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2349  RNA pseudouridine synthase family protein  30.74 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38090  putative pseudouridylate synthase  31.1 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112741 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.69 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1649  RluA family pseudouridine synthase  26.27 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.52 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.73 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997976  normal  0.952064 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  28.03 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0549  pseudouridine synthase  27.93 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  29.35 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7124  pseudouridine synthase, RluA family  28.72 
 
 		 457 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20160  RNA pseudouridine synthase family protein  30.71 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2906  pseudouridine synthase  29.03 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.84 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0072  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  33.51 
 
 		 217 aa  85.9  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  25.17 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0857  RluA family pseudouridine synthase  32.28 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28660  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  29.84 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.727795 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  29.74 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  29.37 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  31.72 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1621  pseudouridine synthase  29.92 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153149 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0252  RluA family pseudouridine synthase  25.29 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.995369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3964  pseudouridine synthase  29.46 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  27.21 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  29.41 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11940  Pseudouridine synthase  29.2 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  30.95 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  29.93 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0354  pseudouridine synthase, RluA family  28.62 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.04 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  25.08 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.72 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4738  pseudouridine synthase  27.98 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  32.25 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4309  pseudouridine synthase  29.67 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0278  RluA family pseudouridine synthase  31.73 
 
 		 468 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  29.56 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.17 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0322  pseudouridine synthase, RluA family  31.73 
 
 		 468 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539792  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  29.96 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  28.83 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0347  pseudouridine synthase, RluA family  28.27 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  32.18 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4836  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.76 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1370  pseudouridine synthase, RluD  32.74 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0921  pseudouridine synthase, RluA family  30.04 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0257  pseudouridine synthase  29.88 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2850  pseudouridine synthase, RluA family  31.96 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0664  23S rRNA pseudouridine synthase D  29.5 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0008107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1002  pseudouridine synthase, RluA family  32.04 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1110  RluA family pseudouridine synthase  27.6 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3345  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.18 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>