More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1309 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0364  putative modulator of DNA gyrase; TldD  66.95 
 
 		 469 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14421  putative modulator of DNA gyrase; TldD  76.18 
 
 		 481 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09221  putative modulator of DNA gyrase; TldD  68.27 
 
 		 481 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000227286 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1166  putative modulator of DNA gyrase; TldD  84.04 
 
 		 470 aa  815    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.564815  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1309  putative modulator of DNA gyrase; TldD  100 
 
 		 469 aa  957    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.102122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10461  putative modulator of DNA gyrase; TldD  66.74 
 
 		 469 aa  647    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157688  hitchhiker  0.0011828 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0957  putative modulator of DNA gyrase; TldD  64.41 
 
 		 474 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.405602  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09191  putative modulator of DNA gyrase; TldD  64.13 
 
 		 474 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.507824  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10261  putative modulator of DNA gyrase; TldD  62.66 
 
 		 474 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10251  putative modulator of DNA gyrase; TldD  62.66 
 
 		 474 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.334911  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1127  microcin-processing peptidase 2  62.77 
 
 		 489 aa  596  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2763  microcin-processing peptidase 2  60.85 
 
 		 490 aa  585  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1476  DNA gyrase modulator peptidase U62  60.04 
 
 		 490 aa  585  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  61.67 
 
 		 488 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  hitchhiker  0.00000000738048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2687  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.15 
 
 		 489 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3429  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  59.15 
 
 		 489 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2754  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  58.72 
 
 		 489 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06837  peptidase  40.27 
 
 		 474 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000862  putative TldD protein  39.38 
 
 		 461 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0351  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.25 
 
 		 462 aa  293  5e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.16723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0070  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.15 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1710  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.89 
 
 		 465 aa  283  5.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.24 
 
 		 464 aa  283  7.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2383  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.45 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0323  TldD/PmbA family protein  35.03 
 
 		 461 aa  280  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0325  tldD protein truncated  34.82 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.61 
 
 		 462 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.39 
 
 		 462 aa  267  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0056  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.88 
 
 		 462 aa  265  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0739  microcin-processing peptidase 2  36.52 
 
 		 471 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.7 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  37.14 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58070  hypothetical protein  35.99 
 
 		 480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0470  putative tldD protein  37.14 
 
 		 470 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.259571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5088  hypothetical protein  35.99 
 
 		 480 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00271  putative suppressor of CsrA inhibitory activity; putative peptidase; involved in the control of DNA gyrase  36.21 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.84 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2234  microcin-processing peptidase 2  35.79 
 
 		 484 aa  239  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.17 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0190  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.23 
 
 		 480 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.498345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.88 
 
 		 477 aa  236  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0825  putative peptidase TldD  35.4 
 
 		 475 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3829  protease TldD  35.74 
 
 		 481 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.637682  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2263  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.21 
 
 		 481 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00176392  decreased coverage  0.00000000093987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2637  tldD protein  36.21 
 
 		 481 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0997282  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.73 
 
 		 471 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  33.55 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03678  hypothetical protein  34.71 
 
 		 481 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0980  TldD protein  33.76 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.06 
 
 		 459 aa  231  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0581  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.55 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3815  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.39 
 
 		 482 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.434753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.39 
 
 		 482 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0504  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.39 
 
 		 482 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4395  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.14 
 
 		 482 aa  229  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3399  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.76 
 
 		 508 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.700717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4553  tldD protein  33.77 
 
 		 481 aa  229  8e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2841  tldD protein  34.92 
 
 		 481 aa  229  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4592  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.7 
 
 		 475 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.647978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3641  microcin-processing peptidase 2  35.55 
 
 		 497 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3465  microcin-processing peptidase 2  35.55 
 
 		 497 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0403  TldD/PmbA family protein  34.04 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0525  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.39 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0876014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1129  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.38 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00884663  normal  0.442465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0486  microcin-processing peptidase 2  35.33 
 
 		 497 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0412  microcin-processing peptidase 2  36.25 
 
 		 483 aa  227  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.0847552 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0269  protease TldD  34.7 
 
 		 481 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0939  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.33 
 
 		 487 aa  226  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2134  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.48 
 
 		 490 aa  226  7e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002390  TldD protein probably a protease  33.62 
 
 		 481 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0382  tldD protein  34.91 
 
 		 481 aa  226  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0567  microcin-processing peptidase 2  35.02 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4091  tldD protein  34.9 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  33.95 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1036  TldD  33.41 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0940  tldD protein  41.88 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0980  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  41.88 
 
 		 479 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4275  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.88 
 
 		 479 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4156  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 		 479 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.867703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0947  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.88 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0258  protease TldD  34.7 
 
 		 481 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.7 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0893  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.25 
 
 		 475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3681  protease TldD  33.54 
 
 		 481 aa  223  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4465  tldD protein  40.79 
 
 		 479 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000206078  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1191  protease TldD  35.09 
 
 		 481 aa  223  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000786436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0472  protease TldD  35.09 
 
 		 481 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0405  protease TldD  35.09 
 
 		 481 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0490  protein TldD  34.63 
 
 		 481 aa  222  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3327  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.36 
 
 		 482 aa  222  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4404  protease TldD  34.87 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.59 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3328  microcin-processing peptidase 2  40.74 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000144333 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0845  microcin-processing peptidase 2  41.43 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3671  protease TldD  35.74 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0812  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.81 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.756344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3747  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  42.45 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0196173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2267  TldD protein  42.72 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0474  TldD protein  35.09 
 
 		 482 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.862683  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3731  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.14 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>