More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1246 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1246  ATPase  100 
 
 
242 aa  478  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1233  ATPase  76.86 
 
 
242 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16791  ABC transporter ATP-binding protein  72.31 
 
 
242 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.588207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09991  ABC transporter ATP-binding protein  65.29 
 
 
242 aa  334  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.198968 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0772  ATPase  58.68 
 
 
244 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.268568  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08191  ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
242 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08261  ABC transporter ATP-binding protein  57.44 
 
 
242 aa  304  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.196348  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08241  ABC transporter ATP-binding protein  56.2 
 
 
244 aa  301  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.482577  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08011  ABC transporter ATP-binding protein  57.92 
 
 
241 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.969375 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0169  ATPase  57.08 
 
 
241 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.655769  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  56.67 
 
 
250 aa  276  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3751  ABC transporter related  54.55 
 
 
242 aa  275  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619335 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2121  ABC transporter related  55.14 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2168  ABC transporter related  55.14 
 
 
243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109942  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  52.7 
 
 
244 aa  268  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  54.13 
 
 
242 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  54.36 
 
 
242 aa  262  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  51.87 
 
 
244 aa  261  6e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  55.91 
 
 
244 aa  261  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 
244 aa  261  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  51.87 
 
 
244 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  50.41 
 
 
244 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  53.68 
 
 
241 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  51.04 
 
 
244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  51.25 
 
 
242 aa  258  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2507  ABC transporter related  55.27 
 
 
243 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  53.31 
 
 
246 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  52.89 
 
 
241 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  56.42 
 
 
243 aa  255  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  53.75 
 
 
241 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  56.14 
 
 
249 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  50.83 
 
 
239 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  51.65 
 
 
241 aa  255  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  56.77 
 
 
255 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  53.94 
 
 
246 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  54.31 
 
 
247 aa  254  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  51.44 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  51.65 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  53.04 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  52.89 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  53.31 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.92 
 
 
336 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  51.03 
 
 
241 aa  252  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  252  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  53.62 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  54.31 
 
 
246 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2272  ABC transporter related  50.83 
 
 
242 aa  251  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  51.3 
 
 
241 aa  251  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  53.94 
 
 
241 aa  251  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  51.24 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  51.74 
 
 
240 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  56.77 
 
 
251 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  50.21 
 
 
243 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1602  ABC transporter related  50.42 
 
 
242 aa  250  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.752612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  52.28 
 
 
261 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1023  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
240 aa  250  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  54.82 
 
 
244 aa  250  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  48.76 
 
 
246 aa  249  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  54.82 
 
 
270 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  51.67 
 
 
333 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  51.65 
 
 
242 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 
241 aa  249  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1068  ABC-transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 
242 aa  248  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  51.45 
 
 
258 aa  248  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 
265 aa  248  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 
241 aa  248  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  51.45 
 
 
258 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  56.28 
 
 
241 aa  248  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 
246 aa  248  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  51.24 
 
 
271 aa  248  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  50 
 
 
246 aa  248  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  50.83 
 
 
265 aa  248  7e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  50 
 
 
243 aa  248  8e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  50 
 
 
241 aa  248  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  51.67 
 
 
332 aa  247  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 
245 aa  247  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  51.67 
 
 
316 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.59 
 
 
241 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  49.17 
 
 
247 aa  246  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  49.17 
 
 
241 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  51.25 
 
 
283 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  47.93 
 
 
241 aa  246  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  53.28 
 
 
277 aa  245  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4168  ABC transporter, ATPase subunit  56.77 
 
 
255 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  52.63 
 
 
249 aa  245  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  51.65 
 
 
239 aa  245  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  50.83 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  50.83 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03017  hypothetical protein  50.83 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00220423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3394  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  50.83 
 
 
241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  53.28 
 
 
279 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>