More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1414 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1414  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 360 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.611512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3284  multicopper oxidase, type 3  48.83 
 
 		 358 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2651  multicopper oxidase3  51.74 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1790  multicopper oxidase, type 3  49.36 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1081  multicopper oxidase type 3  39.55 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000738853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  37.13 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  34.24 
 
 		 527 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  32.67 
 
 		 544 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  31.52 
 
 		 551 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  32.28 
 
 		 549 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  32.63 
 
 		 546 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2558  multicopper oxidase, type 3  34.78 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.797447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  30.92 
 
 		 546 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  34.98 
 
 		 640 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  31.23 
 
 		 551 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  31.23 
 
 		 551 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1680  multicopper oxidase type 3  31.99 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2722  multicopper oxidase, type 3  34.73 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.597321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2294  multicopper oxidase  36.12 
 
 		 431 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198018  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0495  multi-Cu oxidase  35.16 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.826219  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3485  twin-arginine translocation pathway signal  35.38 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4552  multicopper oxidase, type 3  35.38 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0315  multicopper oxidase type 3  34.1 
 
 		 452 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246403  normal  0.0800044 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0072  multicopper oxidase domain-containing protein  34.27 
 
 		 630 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.14066 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2282  multicopper oxidase  32.95 
 
 		 459 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1091  multicopper oxidase type 3  34.62 
 
 		 460 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2579  multicopper oxidase type 3  33.08 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.844134  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2198  multicopper oxidase type 3  34.35 
 
 		 470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4385  twin-arginine translocation pathway signal  34.23 
 
 		 459 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2910  multicopper oxidase type 3  35.45 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546075  normal  0.0186019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2040  multicopper oxidase type 3  34.98 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6291  multicopper oxidase type 3  34.22 
 
 		 431 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5686  multicopper oxidase type 3  34.23 
 
 		 471 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4634  twin-arginine translocation pathway signal  34.35 
 
 		 462 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0735  multicopper oxidase type 3  33.85 
 
 		 470 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2600  multicopper oxidase, type 3  34.8 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345005  normal  0.652084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1040  multicopper oxidase type 3  33.87 
 
 		 609 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6519  putative multicopper oxidase  34.35 
 
 		 446 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1208  multicopper oxidase type 3  34.43 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0477162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1266  multicopper oxidase type 3  34.62 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000624567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1959  multicopper oxidase  34.6 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3353  multicopper oxidase type 3  34.22 
 
 		 431 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3593  multicopper oxidase type 3  32.39 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3981  multicopper oxidase type 3  33.08 
 
 		 467 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2656  multicopper oxidase, type 3  33.21 
 
 		 470 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4102  multicopper oxidase type 3  33.84 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1031  multicopper oxidase type 3  32.31 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4753  twin-arginine translocation pathway signal  33.84 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209254  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5190  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  33.84 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3414  multicopper oxidase, type 2; multicopper oxidase, type 3  33.84 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6070  multicopper oxidase type 3  34.6 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947276  normal  0.0665889 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2764  multicopper oxidase, type 3  33.84 
 
 		 431 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2669  multicopper oxidase, type 3  34.73 
 
 		 443 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.653416  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1967  multicopper oxidase type 3  32.86 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4602  multicopper oxidase type 3  32.57 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.437612  normal  0.307335 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0117  twin-arginine translocation pathway signal; putative copper resistance protein (copA)  32.69 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1634  putative exported copper oxidase  32.44 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  32.44 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4825  multicopper oxidase type 3  32.57 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.355944 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4026  multicopper oxidase type 3  33.08 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3912  multicopper oxidase type 3  33.08 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1904  multicopper oxidase type 3  32.72 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0714  multicopper oxidase family protein  33.21 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0622  multicopper oxidase family protein  33.21 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2009  multicopper oxidase  33.21 
 
 		 397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2455  multicopper oxidase type 3  31.97 
 
 		 359 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1261  multicopper oxidase, type 3  33.08 
 
 		 463 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3725  multicopper oxidase type 3  32.62 
 
 		 381 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1111  multicopper oxidase type 3  28.71 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.471204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0936  twin-arginine translocation pathway signal  33.08 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1080  twin-arginine translocation pathway signal  33.08 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4903  multicopper oxidase type 3  31.8 
 
 		 465 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1204  multicopper oxidase  31.03 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1810  multicopper oxidase, type 3  34.2 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  0.645558 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7874  multicopper oxidase type 3  31.42 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.994377  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0496  multicopper oxidase, type 3  35.63 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  32.45 
 
 		 478 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3418  multicopper oxidase, type 3  33.07 
 
 		 456 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2506  multicopper oxidase, type 3  29.27 
 
 		 561 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000431664  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1542  multicopper oxidase, type 3  32.55 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15670  putative metallo-oxidoreductase  29.01 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128756  hitchhiker  0.0000000000000164901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1348  putative metallo-oxidoreductase  29.01 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2224  multicopper oxidase type 3  34.1 
 
 		 474 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230539 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5862  multicopper oxidase type 3  31.3 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  31.28 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  32.94 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39690  multicopper oxidase-like protein  32.9 
 
 		 456 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9850  multicopper oxidase  32.06 
 
 		 449 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  32.14 
 
 		 460 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  31.73 
 
 		 477 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5029  multicopper oxidase type 3  31.3 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  29.96 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  31.17 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4268  twin-arginine translocation pathway signal  33.08 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.177081 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  29.43 
 
 		 489 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  30.58 
 
 		 460 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00368  laccase  31.4 
 
 		 460 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  34.95 
 
 		 561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0289  multicopper oxidase, type 3  33.33 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>