176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0652 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  80.93 
 
 		 388 aa  661    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  83.76 
 
 		 388 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  100 
 
 		 388 aa  801    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  74.81 
 
 		 384 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  71.09 
 
 		 381 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  71.09 
 
 		 381 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  71.09 
 
 		 381 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  70.57 
 
 		 381 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  71.09 
 
 		 381 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  69.79 
 
 		 381 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  68.49 
 
 		 381 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  68.23 
 
 		 381 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  67.97 
 
 		 381 aa  554  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  61.56 
 
 		 382 aa  501  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  59.9 
 
 		 381 aa  495  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  61.1 
 
 		 380 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  50.52 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  51.2 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  48.44 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  48.7 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  49.6 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  48.42 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  48.16 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  48.16 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  48.16 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  48.16 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  50.79 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  47.48 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  48.33 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  47.21 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  50.66 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  47.87 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  47.21 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  47.21 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  49.6 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  47.21 
 
 		 382 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  47.21 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  48.56 
 
 		 385 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  46.68 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  49.47 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  46.88 
 
 		 385 aa  355  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  47.48 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  48.79 
 
 		 383 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  47.48 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  47.48 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  46.34 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  47.4 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  47.7 
 
 		 409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  47.43 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  44.44 
 
 		 393 aa  322  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  43.33 
 
 		 412 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  42.02 
 
 		 391 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  40.53 
 
 		 398 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  40.21 
 
 		 391 aa  282  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  40.32 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  40.79 
 
 		 372 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  39.21 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  37.92 
 
 		 394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  37.03 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  39.43 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  40.53 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  38.42 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  37.37 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  38.7 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  38.44 
 
 		 387 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  39.68 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  38.54 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  38.32 
 
 		 385 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  38.48 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  39.77 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  35.97 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  36.58 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  39.08 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  36.48 
 
 		 396 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  41.38 
 
 		 390 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  37.11 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  36.17 
 
 		 389 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  35.6 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  33.51 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  36 
 
 		 440 aa  233  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  34.47 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  38.44 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  33.85 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  38.08 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  38.52 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  33.67 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  33.42 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  37.57 
 
 		 356 aa  223  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  37.61 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  35.16 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  39.7 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  37.5 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  37.01 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  39.49 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  36.36 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  36.29 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  32.97 
 
 		 351 aa  215  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  33.33 
 
 		 380 aa  215  9e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  32.85 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  34.81 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>