32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2269 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1115    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  54.89 
 
 		 293 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  52 
 
 		 275 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  49.3 
 
 		 299 aa  140  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  48.92 
 
 		 283 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  48.92 
 
 		 283 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  49.14 
 
 		 255 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2592  hypothetical protein  39 
 
 		 436 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  34.46 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  33.61 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  31.5 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  34.13 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  32.23 
 
 		 242 aa  67  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  30.58 
 
 		 233 aa  66.6  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  29.91 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2265  hypothetical protein  45.45 
 
 		 101 aa  60.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.310683  normal  0.0284056 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4885  hypothetical protein  45.45 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  31.01 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  31.09 
 
 		 131 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1526 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  28.36 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  34.78 
 
 		 404 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  35.45 
 
 		 291 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  34.44 
 
 		 1611 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  31.73 
 
 		 314 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  33.33 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  26.17 
 
 		 360 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  30.3 
 
 		 262 aa  45.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.7 
 
 		 1363 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  35 
 
 		 279 aa  43.9  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>