More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1033 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  41.59 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  41.59 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  40.23 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  42.56 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  38.55 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  36.55 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  42.48 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  35.71 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  40.32 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  41.99 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  39.3 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  39.09 
 
 		 256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  37.5 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  39.76 
 
 		 248 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  36.82 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  38.4 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  36.07 
 
 		 246 aa  159  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  41.96 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  38.96 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  38.21 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  36.73 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  32.52 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  37.55 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  39.41 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  33.07 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  38.92 
 
 		 242 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36.55 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  37.89 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  35.89 
 
 		 269 aa  148  9e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  38.42 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  38.42 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  42.78 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  38.42 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  38.42 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  38.42 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  33.46 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  37.93 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  39.33 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  37.93 
 
 		 238 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  37.93 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  33.6 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  34.25 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  37.02 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  33.86 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  34.69 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  35.66 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  32.91 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  32.91 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  38.12 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  36.94 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  34.87 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  36.21 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  31 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  36.29 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  35.97 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  35.91 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  32.94 
 
 		 251 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  34.4 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  38.33 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  35.92 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  34.01 
 
 		 242 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  32.86 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  33.06 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  34.01 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  38.07 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  33.04 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  31.88 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  38.5 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  34.88 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  32.95 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  33.63 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  34.82 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  33.19 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  30.25 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  32.65 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  32.14 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  31.12 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  36.21 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  34.52 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  39.78 
 
 		 242 aa  122  8e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  31.94 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  30.42 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  34.42 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  31.14 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  32.08 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  32.18 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  36.16 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  36.16 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  36.16 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  36.16 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  36.16 
 
 		 273 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  33.2 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>