More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0886 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 
257 aa  533  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  58.51 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  57.81 
 
 
263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.97 
 
 
249 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  57.63 
 
 
259 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.99 
 
 
253 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.99 
 
 
253 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  56.17 
 
 
252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  56.12 
 
 
248 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  52.5 
 
 
252 aa  279  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  54.17 
 
 
246 aa  278  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  52.12 
 
 
247 aa  276  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.72 
 
 
257 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.14 
 
 
258 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  55.08 
 
 
266 aa  275  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.88 
 
 
258 aa  274  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.88 
 
 
258 aa  274  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.88 
 
 
258 aa  274  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.88 
 
 
258 aa  274  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.88 
 
 
258 aa  274  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.72 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.72 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.46 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.46 
 
 
258 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  54.01 
 
 
264 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  51.67 
 
 
245 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.79 
 
 
258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.19 
 
 
249 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.36 
 
 
249 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.36 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.68 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.74 
 
 
267 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  54.35 
 
 
251 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.56 
 
 
267 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  50.41 
 
 
260 aa  264  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.77 
 
 
249 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  51.97 
 
 
254 aa  263  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.55 
 
 
267 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.19 
 
 
260 aa  263  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.32 
 
 
249 aa  261  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.44 
 
 
249 aa  260  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.34 
 
 
249 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.06 
 
 
248 aa  259  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.23 
 
 
266 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.04 
 
 
265 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.03 
 
 
249 aa  258  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  53.02 
 
 
234 aa  257  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  52.17 
 
 
241 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.2 
 
 
249 aa  257  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.21 
 
 
246 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1631  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.04 
 
 
260 aa  256  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.060942  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  50.43 
 
 
249 aa  256  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.15 
 
 
285 aa  255  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.52 
 
 
259 aa  254  9e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  48.57 
 
 
247 aa  254  9e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  51.08 
 
 
236 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
253 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  52.12 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.33 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
236 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.92 
 
 
256 aa  251  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  51.52 
 
 
244 aa  251  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.28 
 
 
254 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.5 
 
 
246 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0566  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.03 
 
 
238 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  48.76 
 
 
252 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  49.57 
 
 
240 aa  250  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
259 aa  250  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 
258 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.09 
 
 
267 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.28 
 
 
254 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4387  undecaprenyl diphosphate synthase  49.6 
 
 
250 aa  250  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  47.72 
 
 
288 aa  249  2e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  48.54 
 
 
276 aa  249  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.61 
 
 
250 aa  249  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.94 
 
 
282 aa  249  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
240 aa  248  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0542  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
238 aa  248  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  52.84 
 
 
255 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0571  undecaprenyl diphosphate synthase  50 
 
 
262 aa  248  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0212531  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  48.31 
 
 
246 aa  247  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2520  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.58 
 
 
248 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  49.58 
 
 
244 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.09 
 
 
254 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2174  undecaprenyl diphosphate synthase  48.97 
 
 
255 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0790587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1135  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.77 
 
 
252 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1859  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.68 
 
 
257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.470988  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23600  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.52 
 
 
259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.77 
 
 
270 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.57 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.37 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1320  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.2 
 
 
256 aa  242  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.524294  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  51.29 
 
 
247 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
240 aa  242  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1346  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.2 
 
 
256 aa  242  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000376647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
276 aa  242  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>