61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3366 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3366  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 221 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.402677  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  29.05 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2128  putative transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 271 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 234 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 259 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  28.11 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  26.28 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2597  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323808  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  30.07 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  25.55 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  25.55 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  30.7 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 259 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 240 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 234 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  27.12 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 255 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  24.65 
 
 		 261 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 250 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  30.72 
 
 		 293 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>