51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2825 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2825  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249346  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0110  phenylacetic acid degradation-related protein  76.76 
 
 		 160 aa  220  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0327  hypothetical protein  42.18 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000150784  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  33.93 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.36 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.96 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3265  hypothetical protein  26.21 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.96 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  29.79 
 
 		 158 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  26.98 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 232 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  24.44 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  30.3 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.16 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  27.18 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.7 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  23.44 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  32.43 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.28 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  25.86 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  27.72 
 
 		 161 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  29.7 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  30.14 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  26.04 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  27.08 
 
 		 193 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  25.25 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  27.68 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  28.07 
 
 		 161 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 127 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>