More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2361 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2361  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 448 aa  876    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0569  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  66.14 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.289965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0294  microcin-processing peptidase 1  59.73 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.89 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2560  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  54.63 
 
 		 479 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206592  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3182  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  56.1 
 
 		 463 aa  428  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.167211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1346  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  54.25 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0575  microcin-processing peptidase 1  55.96 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.580246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4112  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.61 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1785  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  57.44 
 
 		 442 aa  413  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1687  putative Zn-dependent protease, pmbA-like protein  55.12 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.85577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0310  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.77 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1852  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.24 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.405759  decreased coverage  0.000697877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4708  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.82 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3042  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.22 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0191  pmbA protein  51.71 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  51.38 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0211  pmbA protein  51.48 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0903  PmbA/TldD related protein  49.32 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0529  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.81 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.334504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0485  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.58 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  47.3 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0434  microcin-processing peptidase 1  53.2 
 
 		 445 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0421  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  51.69 
 
 		 448 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4534  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  49.02 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.333963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  46.81 
 
 		 449 aa  332  7.000000000000001e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0064  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  45.5 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.669376  hitchhiker  0.000186098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2687  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  49.2 
 
 		 450 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0650  pmbA protein  40.98 
 
 		 448 aa  323  5e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.501682  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1208  TldD/PmbA family protein  42.6 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.99051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0422  peptidase PmbA  40.52 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0916  microcin-processing peptidase 1  45.11 
 
 		 447 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0214325  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2575  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  44.67 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.336858 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3001  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  45.02 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382298  normal  0.100895 
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  39.41 
 
 		 444 aa  305  9.000000000000001e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3776  peptidase PmbA  39.69 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0390  microcin-processing peptidase 1  37.65 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.248859  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04103  predicted peptidase required for the maturation and secretion of the antibiotic peptide MccB17  39.51 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3759  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.46 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4488  peptidase PmbA  39.46 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5754  peptidase PmbA  39.46 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4849  peptidase PmbA  39.46 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4805  peptidase PmbA  39.46 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04067  hypothetical protein  39.51 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4688  peptidase PmbA  39.01 
 
 		 446 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4838  peptidase PmbA  39.01 
 
 		 446 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4818  peptidase PmbA  39.01 
 
 		 446 aa  299  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4713  peptidase PmbA  39.24 
 
 		 450 aa  299  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4783  peptidase PmbA  38.79 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.137949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4720  peptidase PmbA  38.79 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4760  microcin-processing peptidase 1  40.95 
 
 		 460 aa  292  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447651  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2148  microcin-processing peptidase 1  42.23 
 
 		 446 aa  292  7e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0383  pmbA protein  40.58 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.976724  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  40.37 
 
 		 432 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4384  peptidase PmbA  38.31 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1984  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.04 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  37.14 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0267  peptidase PmbA  39.04 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0275  peptidase PmbA  39.04 
 
 		 446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2415  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.96 
 
 		 452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  36.75 
 
 		 447 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3663  peptidase PmbA  37.56 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2115  peptidase PmbA  36.69 
 
 		 447 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.49 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3821  peptidase PmbA  37.83 
 
 		 446 aa  280  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  41.04 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  38.43 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4388  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.66 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0492  peptidase PmbA  37.05 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.855998  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0572  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.96 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.13 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0600  pmbA protein  40.5 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  40.5 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  37.07 
 
 		 452 aa  269  5.9999999999999995e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0482  PmbA protein  39.49 
 
 		 453 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3740  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.5 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  36.61 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0426  peptidase PmbA  36.38 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0490  peptidase PmbA  36.38 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1169  peptidase PmbA  35.94 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0355671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.71 
 
 		 456 aa  260  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0416  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.81 
 
 		 446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  37.73 
 
 		 447 aa  259  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3631  microcin-processing peptidase 1  36.84 
 
 		 447 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  38.66 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00273  pmbA protein  35.94 
 
 		 443 aa  257  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1132  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  34.56 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0798905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0193  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.32 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3455  microcin-processing peptidase 1  36.84 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2887  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  37.22 
 
 		 468 aa  256  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2264  microcin-processing peptidase 1  38.59 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2133  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  39.22 
 
 		 448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0495  microcin-processing peptidase 1  36.62 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0474  PmbA protein  37.73 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  39.34 
 
 		 469 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3721  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  36.26 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000190523  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0533  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.72 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3805  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.72 
 
 		 461 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0538  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  36.72 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0816  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  38.17 
 
 		 457 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>