More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1955 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 368 aa  729    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2773  histidine kinase  51.42 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.43 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6826  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.95 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2736  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.84 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05453  transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  50.99 
 
 		 360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5743  histidine kinase  46.67 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.022107  hitchhiker  0.000697261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5050  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4369  histidine kinase  48.85 
 
 		 361 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 		 357 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2930  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.24 
 
 		 352 aa  272  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00193882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3051  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.813908  normal  0.38268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 358 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3781  hypothetical protein  37.69 
 
 		 360 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3132  histidine kinase  34.29 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.752444  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  35.9 
 
 		 359 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2693  histidine kinase  33.77 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.751419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  37.92 
 
 		 423 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3224  histidine kinase  34.1 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 425 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35.13 
 
 		 473 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.33 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 473 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 483 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  33.56 
 
 		 482 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04835  two-component system sensor protein  32.55 
 
 		 397 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 454 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.34 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  35.02 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  32.82 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  35.34 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.6 
 
 		 593 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0969  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 488 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00326946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  34.58 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  29.74 
 
 		 455 aa  129  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  35.92 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3119  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 516 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.33 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  32.29 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.26 
 
 		 455 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.02 
 
 		 364 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.02 
 
 		 364 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.33 
 
 		 457 aa  125  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09570  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.224646 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 458 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3085  sensor histidine kinase  32.19 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.389389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  31.11 
 
 		 480 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.45 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2938  ATPase domain-containing protein  37.55 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  28.92 
 
 		 518 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.03 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  28.18 
 
 		 482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 453 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1680  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.69088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  33.54 
 
 		 465 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 487 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5346  histidine kinase  32.13 
 
 		 558 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  0.150364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  32.27 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  31.34 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 507 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  33.11 
 
 		 389 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.94 
 
 		 467 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 613 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  29.72 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  22.65 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  32.89 
 
 		 592 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  32.27 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2589  sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>