More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5810 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4369  histidine kinase  99.72 
 
 		 361 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5050  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 361 aa  720    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 361 aa  720    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.352763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3051  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  81.99 
 
 		 361 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  81.16 
 
 		 361 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05453  transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  68.99 
 
 		 360 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199372 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6826  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  65.47 
 
 		 379 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.25 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2773  histidine kinase  54.73 
 
 		 374 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.45 
 
 		 358 aa  351  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3973  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.03 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5743  histidine kinase  50.57 
 
 		 357 aa  341  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.022107  hitchhiker  0.000697261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.18 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2930  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 352 aa  318  9e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00193882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.57 
 
 		 367 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00300746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 358 aa  305  8.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.813908  normal  0.38268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2736  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 368 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 358 aa  252  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2272  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3781  hypothetical protein  35.77 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  38.46 
 
 		 423 aa  159  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 437 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  37 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  32.61 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3224  histidine kinase  32.92 
 
 		 389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 471 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 458 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3132  histidine kinase  33 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.752444  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.33 
 
 		 512 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.44 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 518 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  35 
 
 		 518 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.69 
 
 		 453 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  31.34 
 
 		 364 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  31.34 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  33.93 
 
 		 391 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 458 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.32 
 
 		 452 aa  135  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.92 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35.11 
 
 		 473 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04835  two-component system sensor protein  31.78 
 
 		 397 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 382 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.65 
 
 		 461 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.65 
 
 		 461 aa  129  7.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 473 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 465 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  30.38 
 
 		 482 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.2 
 
 		 460 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 464 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2693  histidine kinase  30.85 
 
 		 399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.751419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.3 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0968  histidine kinase  29.45 
 
 		 455 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 483 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 364 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 507 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.2 
 
 		 593 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.97 
 
 		 467 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0987  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 471 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000915173  normal  0.356896 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.49 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 723 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.37 
 
 		 467 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3085  sensor histidine kinase  31.15 
 
 		 391 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.389389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2316  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.69 
 
 		 467 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  23.91 
 
 		 473 aa  123  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2476  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.69 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2360  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.69 
 
 		 467 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2260  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.69 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2367  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.69 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.921328  normal  0.463318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.66 
 
 		 463 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  23.91 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.25 
 
 		 467 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  34.48 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  29.43 
 
 		 497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.37 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 536 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0361  two component sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 480 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.49 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 476 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 523 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  32.25 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  32.25 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.25 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.25 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  32.25 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>