129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1082 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1082  peptidase S10, serine carboxypeptidase  100 
 
 		 517 aa  1070    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0601  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.85 
 
 		 492 aa  359  7e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.445118 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1207  peptidase S10 serine carboxypeptidase  38.35 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.34234  normal  0.567138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4660  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.17 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.262908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1174  putative carboxypeptidase-related protein  39.88 
 
 		 573 aa  342  7e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80381  normal  0.157618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5433  peptidase S10 serine carboxypeptidase  39.66 
 
 		 590 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735441  normal  0.336053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3119  peptidase S10, serine carboxypeptidase  42.17 
 
 		 581 aa  340  4e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3077  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.96 
 
 		 533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1063  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.15 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0889  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.04 
 
 		 516 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0961  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.15 
 
 		 513 aa  333  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3225  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.04 
 
 		 516 aa  332  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.343617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1030  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.36 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3133  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.84 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.631529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3329  peptidase S10 serine carboxypeptidase  41.15 
 
 		 513 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3773  peptidase S10, serine carboxypeptidase  40.21 
 
 		 504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3304  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.65 
 
 		 544 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169507  normal  0.0135899 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1649  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.71 
 
 		 494 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0745  peptidase S10, serine carboxypeptidase  38.38 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.164421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2128  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.77 
 
 		 514 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000251865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1195  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.2 
 
 		 490 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2090  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.33 
 
 		 510 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0270  peptidase S10, serine carboxypeptidase  37.24 
 
 		 500 aa  290  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4003  peptidase S10, serine carboxypeptidase  36.31 
 
 		 561 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2114  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.55 
 
 		 514 aa  286  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000253475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0088  peptidase S10 serine carboxypeptidase  36.54 
 
 		 487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32200  carboxypeptidase C (cathepsin A)  37.01 
 
 		 502 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20738  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0603  serine carboxypeptidase  35.54 
 
 		 503 aa  280  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0681  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.23 
 
 		 493 aa  273  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  35.48 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01964  serine carboxypeptidase  32.72 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395984  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2417  peptidase S10, serine carboxypeptidase  34.96 
 
 		 497 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0660734  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2177  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.31 
 
 		 503 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04040  carboxypeptidase C (cathepsin A)  32.92 
 
 		 517 aa  247  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1993  carboxypeptidase  33.86 
 
 		 551 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3251  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.09 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3442  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.47 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4779  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.94 
 
 		 553 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138285  hitchhiker  0.00136432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3088  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.47 
 
 		 558 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5279  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.47 
 
 		 558 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4989  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.47 
 
 		 558 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0371  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.87 
 
 		 558 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5168  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.47 
 
 		 558 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.100052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4639  peptidase S10, serine carboxypeptidase  32.47 
 
 		 558 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5055  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.92 
 
 		 554 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.666059 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0812  serine-type carboxypeptidase family protein  31.68 
 
 		 554 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2026  serine-type carboxypeptidase family protein  32.82 
 
 		 615 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3198  serine-type carboxypeptidase family protein  32.82 
 
 		 615 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0888  serine-type carboxypeptidase family protein  32.82 
 
 		 615 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2721  serine-type carboxypeptidase family protein  32.82 
 
 		 615 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3144  serine carboxypeptidase family protein  32.82 
 
 		 619 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.875872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3181  carboxypeptidase C  32.82 
 
 		 615 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1888  serine-type carboxypeptidase family protein  32.82 
 
 		 615 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4319  peptidase S10, serine carboxypeptidase  29.52 
 
 		 524 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1566  serine-type carboxypeptidase family protein  31.35 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0605  serine-type carboxypeptidase family protein  31.35 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2037  serine carboxypeptidase family protein  31.35 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.931228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2200  serine carboxypeptidase family protein  31.35 
 
 		 554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555603  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0716  serine carboxypeptidase family protein  31.35 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1003  carboxypeptidase  32.65 
 
 		 543 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.199137  normal  0.422421 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2113  serine carboxypeptidase family protein  31.15 
 
 		 554 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0869  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.54 
 
 		 614 aa  220  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510617  normal  0.442404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1758  putative carboxypeptidase  32.92 
 
 		 536 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0934  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.15 
 
 		 613 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0917831 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0132  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.55 
 
 		 536 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0358  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.71 
 
 		 611 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0615  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.55 
 
 		 536 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0841  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.71 
 
 		 611 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.820185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0583  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.55 
 
 		 536 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0131584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1421  serine-type carboxypeptidase family protein  32.24 
 
 		 613 aa  217  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0813  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.42 
 
 		 611 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3933  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  32.02 
 
 		 611 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462563 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2770  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.83 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5084  peptidase S10 serine carboxypeptidase  32.25 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.189262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0540  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.72 
 
 		 536 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1076  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.23 
 
 		 538 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3109  peptidase S10 serine carboxypeptidase  33.06 
 
 		 530 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0516  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.52 
 
 		 536 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371742  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2414  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.12 
 
 		 494 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.385514  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3697  carboxypeptidase C (cathepsin A)-like  29.88 
 
 		 536 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393293  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00179  serine carboxypeptidase  31.28 
 
 		 490 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3491  serine-type carboxypeptidase family protein  30.9 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0412  serine-type carboxypeptidase family protein  30.9 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.614642  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1272  serine-type carboxypeptidase family protein  30.9 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3454  serine carboxypeptidase family protein  30.9 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489337  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3492  serine carboxypeptidase family protein  30.9 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3293  serine-type carboxypeptidase family protein  30.9 
 
 		 544 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2492  serine-type carboxypeptidase family protein  30.9 
 
 		 571 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1930  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.66 
 
 		 514 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1173  serine-type carboxypeptidase family protein  30.23 
 
 		 588 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4619  peptidase S10 serine carboxypeptidase  34.2 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5196  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.59 
 
 		 573 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4351  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.8 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0380  peptidase S10, serine carboxypeptidase  33.06 
 
 		 573 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1968  peptidase S10, serine carboxypeptidase  30.16 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.960831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1444  peptidase S10 serine carboxypeptidase  29.69 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00886012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5118  peptidase S10 serine carboxypeptidase  30.46 
 
 		 573 aa  194  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.302178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3118  peptidase S10, serine carboxypeptidase  31.15 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.226388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5080  peptidase S10 serine carboxypeptidase  37.28 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  unclonable  0.000000000112364  normal  0.0461552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4655  peptidase S10 serine carboxypeptidase  31.17 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>